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目的：对养心通脉有效部位方（apr-YTF）应用于骨髓间充质干细胞（BMSCs）的作用蛋白组学蛋白进行生物信息学分析。方法：根据核素标记相对和绝对定量（iTRAQ）蛋白组学技术确定的apr-YTF对BMSCs作用靶点的差异蛋白，通过DAVID数据库搜索软件结合GO数据库搜索，进行注释和富集度分析， KEGG数据库进行信号转导通路分析；VISANT数据库检索蛋白质相互作用。结果：差异蛋白主要参与102种生物学过程、35种细胞组分、6种分子途径，差异蛋白主要参与3条信号转导通路，这些蛋白在3条信号转导通路上相