基于改进DRLSE模型的甲状腺3D超声图像自动分割

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  摘  要: 从超声图像中准确分割甲状腺区域是甲状腺疾病手术计划的关键之一。本文一方面,针对甲状腺超声3D图像,提出利用边缘指示函数和面积项系数改进的距离正则化水平集演化(Distance Regularized Level Set Evolution,DRLSE)模型来实现甲状腺区域的有效分割;另一方面,根据3D超声图像相邻帧之间甲状腺变化较小的特点,通过计算已分割图像的质心,作为相邻帧图像分割初始点来实现3D图像的自动分割。实验表明,采用本文改进DRLSE模型分割甲状腺3D超声图像,平均分割精度可以达到90%以上。
  关键词: 甲状腺三维超声图像;图像分割;DRLSE模型;边缘指示函数
  中图分类号: R318.5    文献标识码: A    DOI:10.3969/j.issn.1003-6970.2019.04.012
  本文著录格式:冉冬梅,严加勇,崔崤峣,等. 基于改进DRLSE模型的甲状腺3D超声图像自动分割[J]. 软件,2019,40(4):6166
  【Abstract】: Accurate segmentation of the thyroid region from ultrasound images is one of the keys to a surgical plan for thyroid disease. On the one hand, this paper proposes utilizing an improved edge indicator function and the area regular coefficient to improve the Distance Regularized Level Set Evolution (DRLSE) model to achieve effective segmentation of the thyroid region. On the other hand, according to the characteristics of small thyroid change between adjacent frames of the three-dimensional ultrasound image, the centroid of the segmented image is used as the initial point for the adjacent frame image. Thus the segmentation of the three-dimensional image is performed automatically. Experiments show that the improved DRLSE model can segment the thyroid three-dimensional ultrasound image effectively, and the average segmentation accuracy is about 90%.
  【Key words】: Thyroid three-dimensional ultrasound image; Edge indication function; Image segmentation; DRLSE model
  0  引言
  随着甲状腺疾病发展,甲状腺腺体的大小会产生相应的变化,因此,要实现对甲状腺病变的有效诊断和治疗[1],往往需要对甲状腺进行分割,以便更准确地描述出甲状腺的病变区域及周围组织。
  医学图像分割算法种类丰富[2-8],但是甲状腺超声图像分割受限于斑点噪声、形态不规则、对比度低且边缘模糊等因素。目前,国内外学者运用多种算法,已经做了很多关于如何在二维或三维超声图像中分割甲状腺的研究。Chang[9]等人在2010年提出使用径向基函数(RBF,radial basis function)神经网络自动分割甲状腺,并使用粒子群优化算法较为准确地实现甲状腺体积估计;2011年,Selvathi[10]等开发了一种使用机器学习的算法对甲状腺图像自动分类、分割的系统,主要使用SVM、ELM分类器,分割精度分别可达80%,90%;Zhao[11]等人2012年对比了多种用于医学图像分割的方法,如边缘检测、阈值、区域分裂与合并、主动轮廓模型、图论(Graph theory)及归一化割(Ncut)等,并最终选取归一化割作为甲状腺肿瘤的分割算法;2013年Kaur[12]等比较了三种甲状腺分割方法的迭代次数、分割耗时和精度,即无边缘的活动轮廓(Active Contour without edges,ACWE)、基于局部区域的活动轮廓(Localized region Based active contour,LRAC)和DRLSE模型,实验表明LRAC分割性能最佳,分割精度为80%以上。
  除此之外,针对甲状腺三维超声图像分割的方法也很多,2006年Dornheim[13]等人使用3D稳定质量弹簧模型(3D Stable Mass-Spring Models,SMSMs)来创建用于甲状腺软骨分割的3D可变形形状模型,该模型可适应患者特定的形状变化和病理形变;Poudel[14-15]等提出使用活动轮廓和三维重建工具来获取甲状腺的三维模型,随后,还加入均方误差比(ratio of mean square error)和直方图之间的相关性(correlation between histograms),将甲状腺超声图像分割精度提高到86.7%。
  甲狀腺超声图像分割算法多种多样,但受甲状腺结构复杂性和超声成像质量的影响,各类算法均不具有普适性。大多算法计算过程复杂、耗时,而且,不同方法分割结果大多会出现不同程度的过分割和欠分割等问题。综合考虑前述分割算法的优缺点以及分割效率和精度等因素,本文选取了Li[16]提出的距离正则化水平集演化模型来实现甲状腺的分割。针对现有甲状腺3D超声图像数据,本文采用可在滤除噪声的同时很好保持图像边缘信息的各向异性扩散模型,实现对原始图像的滤波操作,降低斑点噪声对分割结果的影响;为提高分割效率,本文在Li模型基础上采用改进的边缘指示函数和可变权系数来控制曲线的演化,实现甲状腺的分割。考虑到连续图像相邻帧图像间像素变化不大的特点,本文每分割完一幅图像,就计算其质心,并将其作为相邻的下一幅图像初始点继续分割。实验表明,本文改进的算法融入了图像的全局信息,提高了甲状腺分割速度和精度,可以实现视频图像的自动分割。   1  预处理
  甲状腺超声图像复杂度较高,斑点噪声较重,并且具有灰度对比度低、边缘模糊等特点。各向异性扩散滤波模型是基于物理学中热传递中热传导的原理来实现图像的平滑过程,该算法能够在平滑图像噪声的同时保留图像的边缘。因此,本文采用各向异性扩散[17](Anisotropic Diffusion)滤波来平滑待处理的甲状腺超声图像。
  2  本文分割算法
  2.1  DRLSE模型
  传统的水平集演化方法稳定性差,并且计算复杂、耗时,曲线演化速度慢,导致图像分割精度和效率都较低。DRLSE模型通过在能量函数中添加水平集正则化项,补偿了水平集函数和符号距离函数的偏差,从而避免了演化过程中曲线的初始化问题,使得水平集曲线的演化无需重新初始化过程即能到达目标区域边界,极大地提高了图像分割效率。该模型的能量泛函为:
  DRLSE模型通过增加正则化项避免了重新初始化过程,使得计算相对简单、分割速度加快。但是,DRLSE模型的外部能量项都依赖于控制曲线演化位置的边缘指示函数g,由式(9)知,函数g利用图像梯度信息来控制演化曲线的停止,而图像边缘点和噪声点梯度值均很高,因此在图像噪声处g容易陷入局部极小,对噪声及其敏感,不利于甲状腺超声图像的分割。DRLSE模型还存在曲线演化方向单一、难以分割弱边缘图像等问题。本文提出一个新的边缘指示函数和面积项系数。
  2.2  改进边缘指示函数
  针对甲状腺超声图像的对比度低、边界模糊等特点,提出基于相位信息的函数g1和综合考虑图像控制噪声和甲状腺边界强弱的函数g2相结合的边缘指示函数gp。
  2.2.1  基于相位信息的函数g1
  图像的相位信息对亮度和对比度不敏感。基于相位的边缘检测是通过计算图像的相位一致性的特征算子来实现[18-19],该方法对图像局部的光照变化具有不变性,对于低对比度图像也能较好检测出边缘信息,更有利于超声图像的边缘检测。其中,相位一致性函数定义为:
  函数 具有局部性质,因此 值与图像局部区域有关,曲线演化过程中可以自适应的根据图像的特点自适应调整大小,提高了图像目标边缘的检验能力。
  3  实验步骤及结果分析
  本文实验均采用前述改进的DRLSE模型来实现甲状腺3D超声图像的分割。实验环境为Intel(R) Core(TM) i7-6700 CPU 3.40 GHz,RAM:8 GB。操作系统:Windows 7,软件环境:MATLAB 2014a。本文实验图像来源于南京同仁医院。
  3.1  实验步骤
  本次实验采用了两个以视频方式呈现的甲状腺3D超声图像集,分别称为DATA1、DATA2。因此实验步骤主要分为两步:第一步是预处理:分别将DATA1、DATA2解码成顺序排列的连续帧图像(分别有104帧和168帧图像),然后使用各向异性扩散滤波平滑噪声;第二步为采用本文改进的DRLSE模型实现甲状腺超声图像的分割。针对连续帧图像相邻图像间像素变化不大的特点,本文通过计算分割结果的质心作为相邻帧图像的初始轮廓点,其中第一帧图像初始轮廓点需手动给定。
  3.2  实验结果分析
  图2为本文改进模型分割准确度验证,分别对比了采用不同函数分割甲状腺的结果,其中(a)图为初始轮廓;(b)为采用 和 的Li模型;(c)为采用 和 相结合的分割结果;(d)为采用 和 相结合的分割结果;(e)是采用 和 结合的分割结果;(f)为手动分割结果。
  在保证其他条件均相同的情况下,本文分割准确度的判断主要通过DC[20](Dice Coefficient)和HD[16](Hausdorff Distance)两个指标来体现,其中DC值表示分割精度,DC越高、HD越小说明分割效果越好。由表1和图2可以看出,采用本文改进边缘指示函数 和 的DRLSE模型来分割甲状腺超声图像的精度明显高于其他情况。若(b)、(c)、(d)图采用的组合,想要达到较好的分割效果,则需要更多的迭代次数和运行时间。本文改进的DRLSE算法明显提高了分割精度和分割效率。
  图3、图4分别对DATA1的第45-54帧和DTA2第108-117帧图像进行分割实验后的结果图,其中每一帧图像分割所得质心坐标均作为相邻下一帧图像的初始轮廓点(第17和108帧图像手动选取)。DATA1第45-54帧和DATA2第108帧-117帧的平均分割精度分别为92.1%和97.9%。
  表2所示为采用DRLSE模型和本文改进后的模型分别对DATA1、DATA2超声图像集进行分割实验的平均精度。在保证其他实验条件相同的情况下,采用本文改进的DRLSE模型,同时把每幅图像的质心作为相邻下一帧图像的初始点来分割甲状腺超声图像,可以达到较好的分割效果。对于两个数据集分割精度均达到了90%以上,明显提高了甲状腺超声图像的分割效率。
  4  结论
  本文针对甲状腺3D超声图像的特点,首先对数据集图像进行预处理,降低噪声影响,然后采用改进边缘指示函數和面积项系数的DRLSE模型来实现甲状腺超声图像的分割。根据连续帧图像的特点,通过计算每一幅分割图像的质心来实现连续帧图像的自动分割,分割精度可以达到90%以上。实验表明,改进算法明显提高了分割精度和效率。
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