【摘 要】
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为获得花生栽培种中有效的InDel标记,本研究基于花生简化基因组检测到的InDel信息,经PCR扩增以及电泳检测验证引物的有效性与多态性,利用生物统计学软件检测InDel标记的多态
【机 构】
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山东省花生研究所,中国海洋大学食品科学与工程学院,东阿县农业技术推广站
【基金项目】
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中央引导地方科技发展专项资金,山东省博士基金(ZR2017BC082),泰山学者特聘专家(ts201712080),青岛市科技惠民计划(17-3-3-49-nsh).
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为获得花生栽培种中有效的InDel标记,本研究基于花生简化基因组检测到的InDel信息,经PCR扩增以及电泳检测验证引物的有效性与多态性,利用生物统计学软件检测InDel标记的多态性水平。结果表明,在花生基因组上设计的39对引物在覆盖4个植物学类型的21份花生中均可获得扩增产物,其中14对引物具有多态性,为总引物数的35.9%,有3对引物位于基因编码区;Shannon指数为0.1914~1.2951,均值为0.5794;多态性信息量(PIC)为0.0907~0.6746,均值为0.3496。本研究筛选获得
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