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生态系统是一个复杂的大系统，很多重要的生态学理论问题都是以生态位(niche)和生物群落概念为基础的。本文将生态位和群落抽象出来，看作是一个耗散结构。建立生态系统中基本概念的量化算子，利用系统模糊分析理论给出具有明确生物意义的生态位和群落的Fuzzy数学模型。并以此讨论生态系统中其他相关概念的数学模型、群落的水平和垂直格局及物种间在资源、斑块、时间三维模糊集上的互惠，共处和竞争关系。初步构建起复杂生态大系统的数学理论框架。