知识产权工作在建设创新型国家中具有重要地位和作用,加强知识产权保护工作的基础和首要环节是确认知识产权的权利归属。我国现行商标确权机制面临着严峻的挑战,机制的运行状况造成商标确权领域的诸多问题,业已成为掣肘商标确权纠纷解决机制健康发展的关键因素,现有的法律规定和制度运行状况,与TRIPS规定的要求尚存在一定的差距。如何有效克服上述障碍,科学构建我国的商标确权机制,充分发挥制度创新的巨大能动作用,激励市场主体珍重商誉,不断创新,已经成为摆在我们面前紧迫而现实的任务。本文在总结我国商标确权制度运行现状的基础上,分析了现行机制的不足和原因,比较了我国现行法律规定和实施机制与有关国际条约的规定,提出对我国现行机制进行改革,既要充分发挥行政快捷、高效的特点,又要通过司法审查提供权利救济途径,确保公正的实现,构建现代化的、兼顾效率和公正的商标确权机制。