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加工贸易转型升级是实现经济质量发展的重要措施.文章以深圳市为研究对象,选取2006-2018年数据对深圳市加工贸易转型升级的影响因素进行实证分析.结果表明:FDI、R&D投入水平、 劳动力成本及人力资本是影响深圳市加工贸易转型升级的重要因素.由此,文章提出提高外商直接投资质量、 提高研发与创新能力、 加强人力资本培育、 积极参与大湾区建设等建议,以促进深圳市加工贸易转型升级.