【摘 要】
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目的 调查云南省大理市啮齿动物冠状病毒（Coronavirus, CoV）和戊型肝炎病毒（Hepatitis E Virus, HEV）感染率。方法 2020年8月～2021年8月在大理市4个乡镇采集啮齿动物样本，采用巢式PCR扩增CoV和HEV的保守序列基因，用生物信息学软件进行同源性与遗传进化分析。结果 共捕获76只啮齿动物属于5属6种，CoV感染动物为褐家鼠（Rattus norvegicu
【机 构】
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大理大学公共卫生学院大理大学预防医学研究所云南省滇西抗病原植物资源筛选研究重点实验室(培育)云南省高校人兽共患病跨境防控与检疫重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金项目（No.U2002218,No.81874274）； 云南省高层次卫生计生技术人才培养项目（No.L-2017027）； 大理大学博士科研启动费项目（No.KYBS2018004）和大理大学人兽共患病跨境防控与检疫创新团体（No.ZKPY2019302）联合资助～～；
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目的 调查云南省大理市啮齿动物冠状病毒（Coronavirus, CoV）和戊型肝炎病毒（Hepatitis E Virus, HEV）感染率。方法 2020年8月～2021年8月在大理市4个乡镇采集啮齿动物样本，采用巢式PCR扩增CoV和HEV的保守序列基因，用生物信息学软件进行同源性与遗传进化分析。结果 共捕获76只啮齿动物属于5属6种，CoV感染动物为褐家鼠（Rattus norvegicus）和黄胸鼠（Rattus tanezumi）,感染率分别为40.74%（11/27）、2.38%（1/42）;HEV感染动物为褐家鼠和黄胸鼠，感染率分别为14.81%（4/27）、2.38%（1/42）。在银桥镇捕获的2只褐家鼠中同时检测到CoV和HEV,感染率为7.41%（2/27）。基于CoV的部分RNA依赖的RNA酶（RNA-dependent RNA polymerase, RdRp）的434 bp核苷酸片段分析，11株CoV阳性样本均来自褐家鼠，为α-CoV,与来自中国福建黄毛鼠（Rattus losea）RtRl/FJ2015同源性最高，为99.73%～99.74%;1株CoV阳性样本来自黄胸鼠，为β-CoV,与来自中国云南板齿鼠（Bandicota indica）Ruili66同源性最高，为98.21%。基于HEV的部分RdRp的340 bp核苷酸片段分析，5株HEV阳性样本均来自褐家鼠，均为HEV-C,与来自中国香港免疫移植病人pt 5株同源性最高，为95.87%～96.21%。结论 云南省大理市啮齿动物中存在CoV和HEV感染，2种病毒的宿主动物与人关系密切，应加强相关病毒的监测与研究。
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