【摘 要】
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目的对在寄生虫中新发现的CD59样蛋白序列进行生物信息学分析,为研究其功能奠定基础。方法应用生物信息学方法,从不同的数据库中查找6种吸虫(肝片吸虫、大片吸虫、日本血吸虫
【机 构】
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广西壮族自治区疾病预防控制中心寄生虫病防制所;
【基金项目】
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广西壮族自治区疾病预防控制中心青年基金(201501)
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目的对在寄生虫中新发现的CD59样蛋白序列进行生物信息学分析,为研究其功能奠定基础。方法应用生物信息学方法,从不同的数据库中查找6种吸虫(肝片吸虫、大片吸虫、日本血吸虫、曼氏血吸虫、华支睾吸虫、麝猫后睾吸虫)的CD59样蛋白序列,应用生物信息学软件对获得的序列进行信号肽和GPI锚定蛋白的预测和分析,应用Clustlw与人CD59序列进行比对分析,并应用Mrbayes构建进化树。结果 6种吸虫分别存在5-11种不同的CD59样蛋白,大小98~137aa,富含半胱氨酸,均有LY6/CD59蛋白质家族的保守膜体"CCXXXXCN"。与人CD59比对,在10个半胱氨酸中有8个相互匹配。根据6种吸虫中获得的46条CD59样蛋白的氨基酸序列构建系统进化树,可将吸虫分为6个不同的大群,其中有3个群均包含裂体科、片形科和后睾科吸虫序列,另外3个为裂体科、片形科和后睾科吸虫各自独立成群。结论吸虫中存在一类CD59样蛋白家族,这类蛋白质与人CD59有类似的结构,进化分析提示该类蛋白质功能具有多样性。
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