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基于统计分析与分段码书的DNA序列压缩新方法
基于统计分析与分段码书的DNA序列压缩新方法
来源 :科学技术与工程 | 被引量 : 0次 | 上传用户:altertig
【摘 要】
:
将DNA序列分成64个碱基一组的短序列。根据每个小段落不同的碱基排列特点,通过对每段中重复频率最高的三碱基组合片段采用特定码书编码,提出了基于统计分析与分段码书的DNA序列
【作 者】
:
熊文萍
孙季丰
【机 构】
:
华南理工大学电子与信息学院
【出 处】
:
科学技术与工程
【发表日期】
:
2012年29期
【关键词】
:
DNA序列
统计分析
码书
分段编码
DNA sequences statistical analysis codebook segmented encodin
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将DNA序列分成64个碱基一组的短序列。根据每个小段落不同的碱基排列特点,通过对每段中重复频率最高的三碱基组合片段采用特定码书编码,提出了基于统计分析与分段码书的DNA序列压缩方法,以达到对DNA数据压缩的目的。实验表明,本算法在大部分常用基准测试序列中达到了比较好的压缩性能。
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