【摘 要】
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目的探讨肝细胞肝癌(LIHC)的瘤内异质性及肿瘤演进机制。方法从TCGA数据库下载肝细胞肝癌的mRNA表达数据及拷贝数变异数据。使用R软件中NMF包对肝细胞肝癌样本进行聚类,并对聚类结果进行PCA分析,使用GSEABase和ESTIMATE包行免疫微环境和免疫浸润分析,使用limma包筛选差异表达基因。对筛选的基因行网络互作和功能富集分析。使用GISTIC方法分析肝细胞肝癌拷贝数变异。结果肝细胞肝癌惠者可分为两个不同亚组NMF1组和NMF2组,两组在免疫评分、肿瘤纯度、免疫细胞组成等方面均显著不同(P&l
【机 构】
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浙江省人民医院（杭州医学院附属人民医院）
【基金项目】
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浙江省健康科技基金资助项目(2021PY036)。
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目的探讨肝细胞肝癌(LIHC)的瘤内异质性及肿瘤演进机制。方法从TCGA数据库下载肝细胞肝癌的mRNA表达数据及拷贝数变异数据。使用R软件中NMF包对肝细胞肝癌样本进行聚类,并对聚类结果进行PCA分析,使用GSEABase和ESTIMATE包行免疫微环境和免疫浸润分析,使用limma包筛选差异表达基因。对筛选的基因行网络互作和功能富集分析。使用GISTIC方法分析肝细胞肝癌拷贝数变异。结果肝细胞肝癌惠者可分为两个不同亚组NMF1组和NMF2组,两组在免疫评分、肿瘤纯度、免疫细胞组成等方面均显著不同(P&l
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