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对五株赤潮异弯藻核糖体转录单元内间隔区（ITS区）进行了PCR扩增和序列测定，并结合GenBank中收录的所有赤潮异弯藻ITS序列信息，比较了它们的遗传距离和相似系数，同时结合GenBank中发布的针胞藻纲其他三个属的代表种ITS序列信息，采用邻接法（neighbour-joining，NJ）和最小进化法（minimum evolution，ME）构建系统发育树。结果表明，五株赤潮异弯藻ITS全序列总长度及碱基组成完全一致，均为538 bp，与GenBank中收录的四株赤潮异弯藻仅有一个碱基不同，遗传距离