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目的揭示金银花HQT基因的变异情况，并阐述HQT基因变异类型与绿原酸含量的相关性。方法以不同产地及品种的金银花为材料，通过RT．2CR法扩增其HQT基因编码区，直接测序，通过多重比对进行HQT基因变异类型分析，进而对其与绿原酸含量之间的相关性进行分析。结果HQT基因编码区变异包括碱基置换突变、插入／缺失突变，部分变异会引起HQT蛋白的改变，并影响绿原酸的表达量。结论金银花HQT基因编码区具有丰富的变异，与忍冬种间分类及绿原酸含量之间具有一定的相关性。