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目的
了解2014—2016年四川省B型流感病毒的流行特点，明确流行株与国际疫苗株的匹配情况及流感病毒全基因组进化特征。
方法选取2014—2016年四川省分离的29株B型流感病毒，全基因组测序后完成序列拼接，采用Bioedit、MEGA5.0软件对各基因片段进行系统发育分析及分子特征分析。
结果2014—2015年以Yamagata系流感病毒为主，2016年以Victoria系流感病毒为主。全基因组分析表明，29株B型流感毒株中有5株发生了B/Yamagata系血凝素（hemagglutinin，HA）和B/Victoria系神经氨酸酶（neuraminidase，NA）间的重配；B/Yamagata系HA氨基酸序列与国际疫苗株B/Massachusetts/2/2012相比，进化树上group I分支毒株突变较多，所分析的15株病毒株均发生K58R、A118P、N126K、S160I、N176Y等14处氨基酸突变；2016年的11株Victoria系毒株与毒株B/Brisbane/60/2008相比，HA基因主要有2个氨基酸位点发生了共有突变（I127V、N139D）。本研究中的29株分离株均未发生NA蛋白酶活性位点及耐药位点的突变。
结论2014—2016年四川省B型流感病毒两系交替流行，29株分离株中的5株出现BY/BV系间神经氨酸酶基因的重配，会导致抗原转变使疫苗失去保护效果，双组分的B型流感疫苗可能更为有效；NA重要的氨基酸位点相对保守。