【摘 要】
：
为挖掘苦参优异种质资源,利用大宗药材苦参现有的EST资源开发EST-SSR标记,分析不同地理种源苦参的遗传多样性,构建其特有的DNA指纹图谱。通过生物信息学手段对NCBI数据库中苦
【机 构】
：
山西农业大学农学院; 长治学院生物科学与技术系; 山西省农业科学院生物技术研究中心; 农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室;
【基金项目】
：
国家自然科学基金项目(21201024);山西省自然科学基金(201701D121105);山西省重点学科建设经费(FSKSC);山西省财政支农项目(2015TGSF-10)
论文部分内容阅读
为挖掘苦参优异种质资源,利用大宗药材苦参现有的EST资源开发EST-SSR标记,分析不同地理种源苦参的遗传多样性,构建其特有的DNA指纹图谱。通过生物信息学手段对NCBI数据库中苦参EST序列进行SSR查找,利用Primer 5.0软件设计EST-SSR引物,筛选多态性引物检测苦参样本DNA差异,采用UPGMA聚类分析样本的遗传多样性,并构建DNA指纹图谱。经分析得到92条Unigene,从中发掘出126个EST-SSR位点分布于61条Unigene上。SSR检出率为66.30%,平均分布距离为0.512kb;共搜索到61种EST-SSR的重复基元,五核苷酸和六核苷酸重复是主要的重复类型,二者出现频率分别为68.25%和25.40%,没有三核苷酸出现,AAAAT/ATTTT与AAGTGG/CCACTT是五、六核苷酸的优势重复类型;设计出65对苦参的EST-SSR引物,随机合成26对,筛选出18对多态性引物可用于苦参样本遗传多样性分析,共检测出77个等位变异,平均每对引物检测出4.3个基因位点,引物多态性比率为69.2%;聚类分析结果表明:苦参材料首先按照居群聚类,在相似系数为0.73处,供试材料按亲缘关系远近分为5大类,相同或相近产地来源的苦参样本聚为一类,呈现出一定的地域性分布规律;筛选到2对核心引物DYH011与DYH018,构建了苦参样本的DNA指纹图谱,作为对不同产地来源苦参鉴定和溯源的依据。
其他文献
<正>1.焊接机器人应用情况中铁山桥集团有限公司(原山海关桥梁厂)是我国桥梁钢结构制造业中综合实力最强的企业,桥梁钢结构制造水平始终引领行业的发展,在国内外享有极高的声
在现代科学技术越来越发达的背景下,企业生产的机械化水平越来越高,对机械设备的依赖也越来越强。企业怎样利用好这些设备,使其发挥最大的功效,如同企业的人力资源管理中如何
钻、修井过程中 ,采用传统方式安装和使用笨重的液压动力大钳操作不便 ,存在许多安全隐患 ,为此 ,BJ管材服务公司研制开发了自动化液压动力大钳系统。该系统为一液压式伸缩管
敏捷开发是近十年来兴起的软件开发模式,2012年11月第七届中国敏捷软件开发大会在北京、深圳、上海三地举办,为国内外敏捷实践者提供了开放的交流平台。从软件开发生命周期的
<正>一路飙升的房价,催生了一大群"夹心层"——既不符合廉租房、经济适用房等政策性住房的租住、购买条件,也无力承担高昂的商品房房价的购房者。于是,这个群体中有的人便把
<正> 地下管线是城市具有给排水、能源、信息传输功能的一项重要基础设施和隐蔽工程。但长期以来,城市建设与管理普遍重视地上,而忽视地下。由于历史原因,我国许多城市地下管
现有信号处理系统中，数字信号处理器编程灵活，处理速度快，被广泛应用于系统中完成各项任务,很多系统中往往会采用DSP与PC机的主从式结构，因而实现DSP与PC机稳定可靠的通信是系统
目的：附红细胞体病是人畜共患病，人和动物均可感染。目前我国感染流行范围很广，安徽省也是疫区之一，其中以阜阳地区较为严重，我们选取阜阳市阜南县地区作为调查地点，调查阜南县门诊
从300对SRAP引物组合中分别筛选出一对对松茸(Tricholoma matsutake)有特异性的引物(ME6,EM26)与一对对假松茸(Tricholoma bakamatsutake)有特异性的引物(ME9,EM7),并将这两
为了减少边缘轮廓上微小变化和边缘噪声对检测结果的影响，提高检测准确率，提出了一种利用边缘轮廓上多尺度自相关矩阵的角点检测算法。该算法首先利用边缘检测器提取图像的轮廓