一、顶层设计的偏差
　　1.环保与农业没有形成一种有效结合。环保部门在秸秆处理方面应起主导作用，严格规范乡镇与农村环境的治理，使人们认识到乡镇与农村环境治理的重要性。整治乡镇与农村能源污染，制定相关政策，强制乡镇与农村改善能源结构。鼓励秸秆做为可靠能源替代燃煤。
　　2.农业部门配合环保部门使秸秆转化出现的一系列问题得到有效解决。
　　二、监管人员多，参与人员少
　　1.现乡各级政府每年投入大量的人力、物力、财力，治理秸秆露天焚烧，预防秸秆露天焚烧发生的火灾，大大增加了各级政府的经济负担。以沈阳市苏家屯白清街道为例，每年春秋两季防火季节，主管领导24小时长期看守，秸秆处理费用每年100～120万元。很多政府总结了一套“三烧政策”：没风时候烧、卫星观测不到时候烧、阴天时候烧。如此往复数年，没有解决办法。
　　2.由于秸秆打捆机设备普及率极低，大部分鄉镇地区没有秸秆捡拾打捆设备，大量农村人口无能力参与。秸秆回收的时间短、占地量大、经济价值低，离不开大量农民参与。秸秆的回收需要短期之内大量收集、分散储存。找到合理出口，让参与者简便加工获益。同时乡镇人口每年采暖燃煤成本迅速增加，取暖费用是农民沉重的经济负担。
　　三、不符合经济规律
　　现有政府鼓励秸秆处理方式：秸秆深翻、大棚堆积、秸秆饲料、制造甲醇、制造沼气、秸秆发电、秸秆固化成型颗粒燃料。以上所有处理方式，只有能源化秸秆发电、秸秆固化成型颗粒燃料是社会常见的有效处理方式。处理量不高、增长速度慢等是主要原因。秸秆固化成型燃料属于低热值、高水分，回收过程中含有沙石，不具备深加工的意义。没有政府大量持续补贴的情况下很难维系。处理所需设备（厂房、厂地、固定资产、水、电、防火设施、粉碎、烘干与造粒）另行不必要投资，造成普通投资者无能力参与。
　　如采用辽宁众缘锅炉制造有限公司研发、生产的一款秸秆成型燃料环保锅炉供暖，免去了粉碎、烘干与造粒，不需要厂房、厂地、固定资产、水、电、防火设施的投入（由于时间点吻合，冬季取暖过后就无需占用耕地）。就地分散储存、减少火灾，锅炉燃烧后产生的灰渣可以直接还田，减少二次污染。让农民积极参与秸秆打捆、运输的工作，同时做到人人参与。秸秆成型燃料低于同等热值的燃煤价格，确保农民与合作社共同致富。