随着多式联运的快速发展，转运枢纽处产生拥堵已经成为普遍现象，拥堵造成转运时间增加并产生额外的碳排放。2021年7月16日，我国正式启动碳排放交易体系，进一步完善了碳价机制，可预期在不远的将来，碳排放成本将成为运输成本的重要组成部分。为探究枢纽拥堵对于多式联运路径决策及碳排放的影响，利用排队模型对枢纽拥堵现象进行模拟，对传统的路径决策模型加以调整，量化等待过程的时间及碳排放，将其纳入绿色多式联运路径选择模型中。针对运输过程中存在的不确定现象，鉴于传统方法的不足，选择基数不确定集刻画运输时间的不确定性，构建相应鲁棒优化模型.根据对偶理论将其转化为较易求解的混合整数线性规划模型，并使用matlab/yalmip进行编程，调用Gurobi进行求解。以天津港到伊尔克什坦口岸的运输网络为实证，验证相关模型可行性，并模拟了不同场景下转运枢纽的拥堵状况，探究转运枢纽的拥堵现象对路径决策及碳排放的影响。结论表明，鲁棒优化方法适用于多式联运路径决策的随机性模拟，决策者能够通过调整不确定参数获取运输方案。一定时限内，枢纽拥堵导致的延迟影响最优路径决策发生变化。在繁忙的枢纽，拥堵现象导致的排放甚至会超过正常转运过程产生的排放。