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为了解叶尔羌河流域的饮用水质和水性疾病情况，进行了专题调查，结果表明叶河流域存在程度不等的高氟、低碘区、致使地方性氟病和地方性甲状腺肿流行，地方性甲状腺肿以中游流域的莎车，泽普患病率高，地方性氟病以下游地区的麦盖提县患病率高，介水传染病急性腹泻、伤寒、痢疾、肝炎的患病率是上游低下游高，且饮用地面水者患病率高于饮用水地下水者。