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模式生物对于人类基因组研究具有重要意义。大肠村菌、线虫、果蝇、小鼠等模式生物在比较定位（ｃｏｍ－ｐａｒａｔｉｖｅｍａｐｐｉｎｇ）、比较测序（ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ）、基因结构与功能的比较研究中起了重大作用。但前四者在形态学、个体发生、发育等方面与脊椎动物相差甚远，基因组差异很大，而小鼠的基因组都丝毫不比人的简单，理想的人类基因组模式生物应该具有小而简单且基因数目与人类接近的基因组。河豚鱼就是这样一种新的模式生物。其基因组特点是大小只有３００～４００Ｍｂ（为人类基因组的１／７～１／８），重复序列少且成簇排列，基因间序列少而小，内含子普遍比人的小，基因数目却与人的大致相当。河豚鱼作为脊椎动物基因组研究的模式生物在比较测序、基因分离、基因结构功能的研究、基因转移等方面有着极高的科学价值和广泛的应用前景。