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目前，高校科技创新团队建设在组织激励机制方面存在缺乏顶层设计和法规政策、存在体制和机制的障碍；缺乏有效管理和优秀中青年学科带头人、缺乏相应的激励机制等问题。高校科技创新团队组织激励机制的形成包括：对创新团队培育的有效机制、完善科技管理体制机制、形成有利学科融合的科技创新环境、构建民主自由和谐的文化机制、建立科学高效的激励评价机制等。