我国部分省市手足口病EV71 VP1基因特征分析

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目的分析我国部分省市手足口病EV71 VP1基因特征。方法对从NCBI上获得我国部分省市和本实验室来源的VP1基因序列99株进行分析,采用MEGA软件构建系统进化树,计算相同或不同基因型及基因亚型毒株的核苷酸与氨基酸的相似性。结果研究序列中C4亚型占96.0%,A亚型(3.0%)和B5亚型(1.0%)较少;A亚型毒株氨基酸变异为非同义突变;部分毒株发生氨基酸突变位点与病毒致病力相关;南方株相对北方株基因序列变异较大,东部株相对中部和西部株基因序列变异较大。结论我国EV71以C4亚型为主;南方株较北方株、东部株较中西部株基因序列变异较大可能与我国气候、交通和人口流动有关;我国A亚型毒株非同义突变及2011年分离自浙江的KF358275突变位点增多是否会引起新的流行需加强后续监测。
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