一种基于四层推理模型的旋转异构体库构造方法

来源 :苏州大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:rdx200901as
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GPCR是一类重要的药物靶标,其侧链构象直接影响着对药物绑定位点的研究.现有的侧链旋转异构体库没有考虑侧链扭角之间的相互影响,而将它们同等看待.本文提出了一种基于四层推理模型的旋转异构体库构造方法,将侧链之间的相互影响也考虑进来,生成了一种富含层次化信息的旋转异构体库.并采用侧链预测程序Rosetta对GPCR Dock 2008和GPCR Dock 2010中的3个目标在本文产生的旋转异构体库的基础上进行预测,其预测精度接近于基于经典的旋转异构体库的侧链预测结果.通过实验还发现,本文提出的采用分层思想的
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