基于RNA-Seq技术分析在金属矿上部生长的芒萁的差异表达基因

来源 :植物资源与环境学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：yww74

【摘要】

：

以生长于广西大厂锡多金属矿上部（重金属胁迫区）和未受矿化或污染影响的矿区外围（对照区）的芒萁〔Dicranopteris pedata（Houtt.）Nakaike〕为实验材料,对芒萁叶片进行转录组高通量测

【作者】

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邹承武宋玮宋慈安雷良奇

【机构】

：

广西大学农学院,广东工业大学计算机学院,桂林理工大学广西隐伏金属矿产勘查重点实验室,桂林理工大学地球科学学院

【出处】

：

植物资源与环境学报

【发表日期】

：

2017年2期

【关键词】

：

芒萁 RNA-SEQ 重金属胁迫差异表达基因 Dicranopteris pedata(Houtt.) NakaikeRNA-Seqheavy metal s

【基金项目】

：

国家自然科学基金资助项目（41363003,40972220）

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以生长于广西大厂锡多金属矿上部（重金属胁迫区）和未受矿化或污染影响的矿区外围（对照区）的芒萁〔Dicranopteris pedata（Houtt.）Nakaike〕为实验材料,对芒萁叶片进行转录组高通量测序,并对组装得到的unigenes经NCBI官方非冗余蛋白质序列数据库（Nr）、NCBI官方非冗余核苷酸序列数据库（Nt）、KEGG直系同源数据库（KO）、Swiss-Prot数据库（Swiss-Prot）、蛋白质家族数据库（Pfam）、基因功能分类体系数据库（GO）和真核生物直系同源序列数据库（K0G

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