【摘 要】
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【目的】开发葡萄无核性状的SSR新分子标记,对葡萄杂种后代进行早期无核性状鉴定,为分子标记辅助育种奠定基础。【方法】对母本‘红地球’与父本‘森田尼无核’及F1代杂交群
【机 构】
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中国农业科学院郑州果树研究所,河南农业大学园艺学院
【基金项目】
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国家葡萄产业技术体系(CARS-29-yc-1);中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ASTIP-2017-ZFRI-02);果树(桃、枣、苹果、葡萄等)优异种质资源创新和高效育种体系构建(151100110900)
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【目的】开发葡萄无核性状的SSR新分子标记,对葡萄杂种后代进行早期无核性状鉴定,为分子标记辅助育种奠定基础。【方法】对母本‘红地球’与父本‘森田尼无核’及F1代杂交群体的133份葡萄材料进行RAD-seq,将测序结果比对到参考基因组上;运用SAMtools软件生成Ca SFS软件所需的pileup和glf文件,过滤获得亲本之间的有效SNP集;采用窗口滑动的方法,确定每个窗口的基因型,选择以每15个SNP为一个窗口,每次滑动一个SNP,得到每个个体的基因型并生成bin图;对生成的bin图采用拟测交的方式利用
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