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选择消化专业领域。1942年,郑芝田从国立北京大学医学院(北京大学医学部前身)毕业,留校在内科工作。这一时期,太平洋战争爆发,北京协和医院被迫关闭,大批医护人员进入北京大学第一医院(以下简称北大医院),其中不乏一批知识渊博、治学严谨的知名教授。北京协和医院老院长王锡炽将住院医师培训制度带到了北大医院,推动了医教研工作的发展。