目的 分析浙江省首例报道的人禽流感H5N1病毒株A/Zhejiang/16/2006的基因特性与系统进化关系.方法 对A/Zhejiang/16/2006病毒株的全序列8个基因片段作序列测定,并与国内外相关病毒株进行同源性与系统进化比较.结果 A/zhejiang/16/2006的HA序列,与周边国家和地区的H5N1病毒株之间存在11个氨基酸的差异,但这些差异并未影响到相关糖基化位点的稳定;在NA区,1997年以后的毒株均缺少第49～68位的20个氨基酸.总体上中国大陆近年H5N1毒株的8个基因片段与周边国家和地区毒株相比形成另一个分支,并与1996-1997年香港及广东的H5N1毒株之间存在较大差异,但有个别毒株的基因片段在系统进化树上远离当前的毒株而更接近1997年的病毒株.结论 A/zhejiang/16/2006与中国大陆近年的病毒株自成一个体系,与周边国家和地区的H5N1病毒株之间存在一定差异。