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低骨头矿物质密度和在胃肠的疾病的骨折的增加的风险有多因素的致病。煽动性的肠疾病(IBD ) 与骨质疏松症和 osteopenia 的增加的风险被联系了，流行病的研究与 IBD 在病人报导了低骨头质量的增加的流行。当然，遗传玩一个重要角色与象全身的发炎那样的另外的因素一起，营养不良，性腺机能减退，在 IBD 的糖皮质激素治疗和另外的生活方式因素。在分子的水平职业人员煽动性的 cytokines 在 IBD 贡献肠的有免疫力的反应被知道提高骨吸收。有基因，影响造骨细胞功能， LRP5 可以涉及骨胳的发展，是可