【摘 要】
:
目的筛选与老年肺腺癌患者肿瘤浸润免疫细胞相关的关键基因。方法回顾性分析,训练集的基因表达数据来源于癌症基因组图谱数据库,验证集来源于基因表达综合数据库的GSE72094数据集,筛选年龄≥75岁的肺腺癌患者91例,14例匹配的正常样本。肿瘤浸润免疫细胞水平由反卷积算法计算,训练集采用加权基因共表达网络分析筛选与肿瘤浸润免疫细胞水平相关的关键基因,并应用外部数据集验证。结果在老年肺腺癌患者中,IKZF
【机 构】
:
北京大学第五临床医学院 100730,北京大学第五临床医学院 北京医院肿瘤内科 国家老年医学中心 中国医学科学院老年医学研究院 100730,北京大学第五临床医学院 北京医院肿瘤内科 国家老年医学中心
论文部分内容阅读
目的筛选与老年肺腺癌患者肿瘤浸润免疫细胞相关的关键基因。
方法回顾性分析,训练集的基因表达数据来源于癌症基因组图谱数据库,验证集来源于基因表达综合数据库的GSE72094数据集,筛选年龄≥75岁的肺腺癌患者91例,14例匹配的正常样本。肿瘤浸润免疫细胞水平由反卷积算法计算,训练集采用加权基因共表达网络分析筛选与肿瘤浸润免疫细胞水平相关的关键基因,并应用外部数据集验证。
结果在老年肺腺癌患者中,IKZF1和PRKCB的高表达与自身免疫疾病和T细胞受体信号通路等相关,其编码的蛋白可与IL2RB、LCK和CD5等多种免疫调节因子相互作用。在IKZF1和PRKCB基因高表达患者中,PD-L1、PD-1和CTLA-4等免疫检查点基因的表达高于低表达患者(均P<0.01)。验证集结果表明,CD8+T细胞水平与IKZF1(r=0.75)和PRKCB(r=0.65)的表达相关(均P<0.01)。
结论老年肺腺癌患者肿瘤组织中的IKZF1和PRKCB表达与肿瘤浸润CD8+T细胞和免疫检查点基因的表达相关。
其他文献
目的探讨感染性眼内炎的致病因素、病原体分布及其耐药性。方法收集2011年1月至2020年12月就诊于山西省眼科医院检验科疑似感染性眼内炎1364例(1364只眼)患者的临床资料。其中,男性1159例(1159只眼),女性205例(205只眼);年龄1-83岁,平均年龄(47.3±13.5)岁。抽取患者的房水和玻璃体液进行病原体培养实验,鉴定感染菌种类别和药物敏感性试验,采用WHONET5.6软件分析眼内炎患者的临床特点、病原菌分布以及主要病原菌的耐药性情况。感染性眼内炎病原菌分布和致病因素分布采用例数和百
目的探讨DWI影像组学在克罗恩病(CD)患者末端回肠炎症活动性中的诊断价值。方法选择浙江中医药大学附属第一医院2016年1月至2020年4月经病理检查诊断CD患者89例,以末端回肠节段性评分(CDEIS)临界值7分为界,将所有患者分为活动组53例与非活动组36例。基于DWI序列勾画感兴趣区,将所有患者以7∶3分为训练组与验证组,利用多因素回归分析筛选具有统计学差异的特征,建立K-近邻函数模型(KNN),计算AUC、灵敏度、特异度。结果共保留具有统计学差异的特征共9个,基于图像特征值建立的KNN模型,训练组
目的探讨术前D-二聚体联合中性粒细胞-淋巴细胞比值(NLR)(DD-NLR)评分评估胰腺导管腺癌(PDAC)患者预后的价值。方法回顾2009年1月至2016年12月在温州医科大学附属浙江省台州医院行手术切除治疗的72例PDAC患者临床资料和术前实验室指标,计算NLR和DD-NLR评分。采用χ2检验分析D-二聚体、NLR及DD-NLR评分与临床病理特征之间的关系;采用Kaplan-Meier方法绘制生存曲线,组间总生存率的比较采用log-rank检验;采用Cox比例风险回归模型(逐步向后法)进行单因素和多因
目的探讨分化型甲状腺癌(DTC)神经内分泌分化(NED)与131I 治疗疗效的关系。方法收集46例1991年3月至2017年5月在中国科学院大学附属肿瘤医院行131I 治疗伴随远处转移DTC患者的病变甲状腺组织石蜡标本,采用免疫组化法检测NED标志性蛋白嗜铬粒蛋白A(CgA)、神经细胞黏附分子1(CD56)、突触蛋白(Syn)、促甲状腺激素受体(TSHR)、钠碘同向转运体(NIS)的表达。采用χ2检验分析CgA、CD56、Syn表达与碘代谢关键基因TSHR、NI
目的分析经验性抗真菌治疗对支气管肺泡灌洗液(BALF)半乳甘露聚糖(GM)在慢性阻塞性肺疾病(COPD)合并侵袭性肺曲霉病(IPA)中诊断敏感度的影响。方法选取福建医科大学附属泉州第一医院2015年1月至2019年1月收治的COPD合并IPA为研究对象,气管镜前给予抗真菌药者为经验性治疗组,余为诊断驱动治疗组,回顾性分析两组BALF GM结果。结果共66例COPD合并IPA者纳入分析,其中经验性治
目的探讨人工智能(AI)在新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者胸部CT病变范围评估中的应用价值。方法收集绍兴市人民医院2020年1月22日至3月8日经核酸检测确诊为COVID-19患者25例,根据分型将患者分为危重-重型患者(A组)11例和普通-轻型患者(B组)14例,共行胸部CT检查85次。采用AI软件和CT评分评估所有图像的病变累及范围,记录医师完成评估所需时间以及评估结果,并绘制不同时间段变化趋势图;人工CT评分与AI评估病变累及范围进行比较和相关性分析。结果A组AI评估病变累及范围、人工CT评
目的在老年下肢水肿的小鼠模型中观察下肢静脉和动脉血管外膜及其周围结缔组织(PACT)通路对血管周围水肿的引流作用,为理解老年人下肢水肿的引流和清除提供新的研究视角。方法分别在BAIB/C小鼠下肢足踝部静脉和动脉血管周围组织间隙中注射不同剂量的荧光素钠生理盐水(FluoNa),制作下肢水肿模型,然后在股动静脉鞘水平,采用体式荧光显微镜观察和记录血管PACT通路对于水肿的引流作用。结果通过追踪足踝部F
目的对照分析有无合并基础疾病的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者首次胸部高分辨率CT(HRCT)的影像学特点。方法收集2020年1月24日至2月14日杭州市西溪医院经核酸检测确诊且合并基础疾病的COVID-19患者22例(A组),选取同时段年龄及性别相仿的无基础疾病COVID-19患者25例(B组)。对比分析两组患者首次胸部HRCT表现的差异。结果A组患者累及的肺叶数较B组多,差异有统计学意义(P<0.01),其中两组右肺中叶病灶数差异有统计学意义(P<0.05),余各肺叶病灶数差异均无
见到患者第一眼?心里咯噔一下rn那是几年前的一个夏季早晨,8点钟我刚上班,120急救电话就响起,是附近的社区医院打来的.rn患者是一位60岁左右的大叔,在晨练时突发胸痛1小时就
病理学对深入认识和研究眼肿瘤眼眶病的发病机制及其发生和发展的规律十分重要,在眼肿瘤眼眶病的诊断、鉴别诊断、个性化治疗方案的制定、监测病情变化及评估预后等方面可提供重要的客观依据,具有不可或缺的作用。本文中笔者在结合相关文献以及多年临床病理学检测的应用心得,归纳和总结了病理学检测对眼肿瘤眼眶病诊断、治疗及学术研究中的实际价值,期望引起眼科医师的重视。