【摘 要】
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目的 利用生物信息学方法分析溃疡性结肠炎（UC）的枢纽基因和关键通路。方法 通过基因表达数据库（GEO）下载UC表达谱芯片GSE134025。利用R语言的Limma包筛选UC组与正常组肠黏膜细胞差异表达基因，对这些基因进行GO和KEGG分析；利用STRING数据库构建蛋白互作网络（PPI）并将结果导入Cytoscape筛选出核心基因；利用KEGG mapper绘制核心基因所在的信号通路图。结果 筛
【基金项目】
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国家自然科学基金（31900038）； 山西省自然科学基金（201801D221284）；
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目的 利用生物信息学方法分析溃疡性结肠炎（UC）的枢纽基因和关键通路。方法 通过基因表达数据库（GEO）下载UC表达谱芯片GSE134025。利用R语言的Limma包筛选UC组与正常组肠黏膜细胞差异表达基因，对这些基因进行GO和KEGG分析；利用STRING数据库构建蛋白互作网络（PPI）并将结果导入Cytoscape筛选出核心基因；利用KEGG mapper绘制核心基因所在的信号通路图。结果 筛选出190个差异表达基因，其中147个上调，43个下调。GO分析结果表明，差异表达基因主要涉及炎症反应、细胞增殖的正调控等生物学过程，主要富集于细胞膜、质膜等细胞成分，具有肝素结合、生长因子等分子功能。KEGG分析显示差异基因主要富集于趋化因子信号通路，细胞因子受体相互作用等相关信号通路。从PPI网络中筛选出10个枢纽基因：白细胞介素6（IL-6）、CXC趋化因子配体8（CXCL8）、CXCL10、CXCL1、CXCL9、膜联素A1（ANXA1）、IL-1β、CC趋化因子配体20（CCL20）、CXCL2、CXCL11,其中多个基因位于IL-17调控的信号通路下游。结论 发现了10个与UC发病风险相关的枢纽基因，IL-17可能通过这些核心基因调控UC的发生发展。
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