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真菌是自然界中一个大的生物类群，就医学真菌而言，如何确定其分类地位以及属、种等问题很多，传统分类法从形态表型出发，存在着一定的片面性。随着分子生物学技术的应用和发展，医学真菌方面已逐渐形成了以基因分析为基础的分类与鉴定系统；真核生物的rRNA基因结构的独特性使其在医学真菌的分类与鉴定中应用广泛，结合聚合酶链反应、随机扩增片段多态性、限制性酶切片段多态性及核苷酸序列分析等技术，rRNA基因适合于各分类水平(种系发生、种内分型及种间鉴别)的研究。