基于高通量测序的都匀地区福鼎大白种茶树根茎叶分析

来源 :广西植物 | 被引量 : 0次 | 上传用户：jiejie2717

【摘要】

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为探究茶树中茶多酚等产物代谢途径的相关基因,该研究以贵州都匀地区福鼎大白种茶树的根茎叶为对象,利用高通量测序技术构建茶的转录组数据库并筛选其根茎叶差异表达基因。结

【作者】

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王芬裴会敏文狄陈志刘荣姚玉仙马媛

【机构】

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黔南民族师范学院生物科学与农学院

【出处】

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广西植物

【发表日期】

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2020年9期

【关键词】

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都匀地区福鼎大白种根茎叶高通量测序差异基因 DuyunFudingdabairootstemleafhigh-throughput sequencing

【基金项目】

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国家自然科学基金(31900486),贵州省科技厅基础研究计划项目(黔科合基础[2019]1298),贵州省教育厅青年科技人才成长项目(黔教合KY字[2018]420),黔南民族师范学院科研创新团队项目(Qnsyk201605,QNYSKYTD2018011),黔南民族师范学院高层次人才引进研究专项项目(qnsyrc201611),黔南州科技计划项目(黔南科合学科建设农学(2018)5号和黔南科合

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为探究茶树中茶多酚等产物代谢途径的相关基因,该研究以贵州都匀地区福鼎大白种茶树的根茎叶为对象,利用高通量测序技术构建茶的转录组数据库并筛选其根茎叶差异表达基因。结果表明:共获得70.88 Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到6.33 Gb,Q30碱基百分比在93.22%以上。将Clean Reads与中国种茶树参考基因组进行序列比对,比对效率从87.83%到91.14%。基于比对结果,进行可变剪接预测分析和基因结构优化分析,发掘新基因13531个,其中10244个得到功能注释。利用

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