目的了解健康人群肠道病毒动态变化及手足口病肠道病毒型别,探讨健康人群肠道病毒在手足口病传播过程中的作用。方法采用多阶段整群抽样的方法,分别于手足口病流行前期(3-4月)、流行高峰期(6-7月)、流行后期(10-11月)采集健康人群及手足口病病例粪便标本,采用荧光定量PCR进行肠道病毒核酸检测。结果 3次共采集健康人群粪便标本1235份,肠道病毒通用引物阳性177份,阳性率为14.33%,检出COAX16型肠道病毒1株,非EV71非Cox A16其它型肠道病毒176株;手足口病病原学以EV71和Cox A16型为主,非EV71非Cox A16其他肠道病毒仅占26.98%。不同时期、不同年龄组带毒率有统计学意义(P<0.05)。<1岁组健康人群肠道病毒阳性率最高,而发病率最低,呈相反趋势;1~组发病率最高,从1~组呈相同趋势。健康人群肠道病毒阳性率与发病率无相关性(P>0.05)。结论健康人群以携带非EV71非Cox A16肠道病毒为主,健康人群肠道病毒带毒在手足口病传播意义不大。