【摘 要】
：
目的 利用生物信息学方法筛选管腔/雄激素受体(LAR)亚型三阴性乳腺癌(TNBC)的特异性生物学靶点,并分析其与患者预后的关系.方法 从TCGA数据库下载乳腺癌患者转录组测序数据,包括113例TNBC患者和597例非TNBC患者.筛选TNBC中差异表达上调的基因,然后采用多尺度嵌入式基因共表达网络分析技术筛选核心模块和核心基因.使用数据集GSE76245和UALCAN数据库对核心基因在不同亚型TNBC中的表达进行验证,使用CCLE数据库探索该基因在泛癌细胞系和乳腺癌亚组细胞系中的表达差异.使用Shao数据
【机 构】
：
江苏省徐州市第一人民医院甲乳外科,徐州市 221005;中山大学肿瘤防治中心肿瘤内科,广东省广州市 510060;广西中医药大学附属桂林市中医医院乳腺科,桂林市 541002
论文部分内容阅读
目的 利用生物信息学方法筛选管腔/雄激素受体(LAR)亚型三阴性乳腺癌(TNBC)的特异性生物学靶点,并分析其与患者预后的关系.方法 从TCGA数据库下载乳腺癌患者转录组测序数据,包括113例TNBC患者和597例非TNBC患者.筛选TNBC中差异表达上调的基因,然后采用多尺度嵌入式基因共表达网络分析技术筛选核心模块和核心基因.使用数据集GSE76245和UALCAN数据库对核心基因在不同亚型TNBC中的表达进行验证,使用CCLE数据库探索该基因在泛癌细胞系和乳腺癌亚组细胞系中的表达差异.使用Shao数据集分析核心基因与LAR亚型TNBC患者预后的关系.结果 与非TNBC患者相比,TNBC患者中存在1903个差异表达上调,这些基因被聚类为21个模块,其中C3模块是核心模块,催乳素诱导蛋白(PIP)基因是核心基因.GSE76245数据集和UALCAN验证结果均提示PIP基因在LAR亚型TNBC中的表达高于其他亚型TNBC(均P<0.05),CCLE数据库分析结果提示PIP在泛癌细胞系和乳腺癌亚组细胞系中的表达存在差异(均P<0.05).预后分析结果提示,PIP基因表达量降低是LAR亚型TNBC患者预后的独立危险因素,低表达的LAR亚型患者的3年和5年疾病累计复发风险均高于高表达者(均P<0.05).结论 PIP基因在LAR亚型TNBC中的表达高于其他亚型,其或可成为LAR亚型TNBC的特异性生物学靶点,上调该基因的表达或有助于改善此类型乳腺癌患者的预后.
其他文献
目的 评估肥达试验和Tubex试验在伤寒、甲型副伤寒诊断中的应用价值.方法 采集2006-2012年广西伤寒、甲型副伤寒常规监测和暴发疫情中的164例确诊病例血清,应用肥达试验、Tubex-TF试验和Tubex-PA试验进行伤寒、甲型副伤寒血清抗体检测;分别计算3种试验血清检测结果的灵敏度、特异度、假阳性率、假阴性率、约登指数和Kappa值等指标,对检测结果进行评估.结果 以病原分离为金标准,对106例病原分离阳性的伤寒血清进行检测,Tubex-TF试验的灵敏度为66.98％,特异度为78.93％,阳性预
目的 探讨儿童非神经性神经源性膀胱(NNB)的临床特点并分析其治疗效果.方法 回顾性分析12例NNB患儿的临床资料,并结合相关文献,总结其临床特点及治疗效果.结果 12例NNB患儿中6例有长期憋尿史,2例有长期尿频尿急史,2例发病前抗拒上学伴抵触情绪,1例有间断便秘史,另1例无明显诱因或病因;临床表现以尿失禁为主,部分为排尿困难或反复尿路感染.7例继发尿路严重损害的NNB患儿行手术治疗,术后给予口服奥昔布宁+清洁间歇导尿+生物反馈训练,其中3例偶有自行排尿;5例轻症NNB患儿采取保守治疗,给予口服奥昔布宁
目的 比较弹力袜加压与交通静脉离断术治疗下肢静脉性溃疡(VLU)的疗效.方法 将108例VLU患者随机分为对照组和观察组,每组54例.对照组患者采用交通静脉离断术治疗,观察组患者采用弹力袜加压治疗.比较两组患者治疗前后的创面积分、疼痛视觉模拟量表(VAS)评分、治疗28 d时的疗效,治疗后6个月内溃疡愈合及并发症情况,治疗3个月、6个月时患肢小腿周径缩小值及出院后24个月内溃疡复发情况.结果 治疗后,两组患者的创面积分、VAS疼痛评分均降低,且观察组患者的创面积分、VAS评分下降更明显(均P<0.05).
目的 探讨引导骨再生(GBR)技术联合颌骨囊肿刮治术治疗牙源性颌骨囊肿的临床疗效.方法 将88例牙源性颌骨囊肿患者随机分为联合组和对照组,各44例.对照组给予单纯颌骨囊肿刮治术治疗,联合组在对照组基础上给予GBR技术治疗.比较两组患者的手术相关指标、囊肿体积减小量、囊肿面积减小量、骨密度、骨质增生厚度、颌骨高度和宽度,评价两组患者的治疗效果,记录疼痛、感染、复发情况.结果 与对照组相比,联合组手术时间、住院时间延长,术中出血量增加;联合组术后3个月、6个月的囊肿体积减小量、囊肿面积减小量、骨密度、骨质增生
目的 探究在鼻咽癌自适应放疗中,应用基于配准对抗神经网络的RegGAN模型将锥形束CT(CBCT)图像转换为伪CT图像的可行性.方法 回顾60例鼻咽癌患者第1次用于图像引导放疗的CBCT图像和计划CT图像,其中47例作为训练集,13例作为测试集.建立基于配准对抗神经网络的RegGAN模型,将CBCT图像转换为伪CT图像.选用Pix2 Pix模型和Cycle-consistency模型作为参考模型,在相同训练集上进行模型训练后使用测试集进行图像转换.比较利用3种模型转换的伪CT图像的平均绝对误差(MAE)、
目的 观察黎医药熨疗法联合针刺治疗腰椎间盘突出型根性坐骨神经痛急性期患者的临床效果及对患者血清致疼因子和炎症因子水平的影响.方法 将114例腰椎间盘突出型根性坐骨神经痛急性期患者随机分为对照组与观察组,每组57例.对照组患者给予常规中医针刺治疗,观察组患者给予黎医药熨疗法联合常规中医针刺治疗.治疗后评价两组患者的中医疗效,并比较两组患者治疗前后的疼痛分级指数(PRI)、疼痛视觉模拟量表(VAS)评分、现有疼痛强度(PPI)评分,以及血清致疼因子(P物质、神经肽Y、神经激肽1)及炎症因子[白细胞介素6(IL
目的 探讨重复经颅磁刺激(rTMS)联合感觉统合训练对精神发育迟滞患儿智商及运动发育的影响.方法 回顾性分析89例精神发育迟滞患儿的临床资料,根据所采用的康复治疗方式将其分为对照组(n=40)和观察组(n=49).对照组和观察组患儿分别接受单纯的感觉统合训练、rTMS联合感觉统合训练.治疗前后,采用中国修订韦氏儿童智力量表评估患儿的智商,分别采用粗大运动功能评估(GMFM)量表和Peabody精细运动发育量表(PDMS-FM)评价患儿粗大运动功能和双手精细运动能力.结果 治疗后,两组患儿言语智商、操作智商
目的 分析老年结核病患者外周血中恒定自然杀伤T淋巴细胞(iNKT)的比例、表型及功能状态.方法 选取150例结核病患者,按照年龄将其分为老年结核病组(年龄≥60岁,n=68)、非老年结核病组(年龄<60岁,n=82),同时选取80例老年健康志愿者作为对照组.采用流式细胞术检测3组研究对象外周血iNKT占淋巴细胞的比例及iNKT表型CD69、CD161、CD62 L、CD122的表达;采用胞内细胞因子染色法,分析各组iNKT在氟波醇乙酯(PMA)/离子霉素(Iono)刺激后分泌γ干扰素(IFN-γ)和白细胞
目的 观察斜外侧腰椎间融合术(OLIF)联合补阳还五汤治疗退行性腰椎疾病的早期临床疗效.方法 将84例退行性腰椎疾病患者随机分为观察组和对照组,每组42例.两组患者均行OLIF术,术后均给予常规治疗,观察组患者术后第2天给予补阳还五汤口服4周.术前、术后1周、4周、3个月及6个月时,采用疼痛视觉模拟量表(VAS)、日本骨科学会(JOA)脊柱评分量表评估两患者疼痛情况及脊柱功能,评价治疗效果.结果 术后4周、3个月时,观察组患者疼痛VAS评分低于对照组,术后4周、3个月、6个月时,观察组患者JOA脊柱评分均
目的 探讨阿魏酸哌嗪联合羟苯磺酸钙治疗糖尿病肾病的疗效及对血清炎症因子和氧化应激因子水平的影响.方法 将136例糖尿病肾病患者随机分为对照组、阿魏酸哌嗪组、羟苯磺酸钙组、联合(阿魏酸哌嗪+羟苯磺酸钙)组,各34例.对照组接受常规治疗,阿魏酸哌嗪组、羟苯磺酸钙组、联合组在常规治疗基础上接受相应药物治疗.治疗12周后比较4组患者的疗效、肾功能指标、炎症因子、氧化应激因子水平,记录治疗期间不良反应发生情况.结果 治疗后,联合组患者的治疗总有效率高于其他3组患者(均P<0.05).阿魏酸哌嗪组、羟苯磺酸钙组、联合