【摘 要】
:
目的了解某禽类养殖场工人间的1起流感样病例暴发疫情的流行病学特点,确定疫情性质,分析流感病毒是否存在变异或基因重组,试阐述流感病毒来源。方法采用个案调查等流行病学调查方法开展现场调查,采集所有流感样病例咽拭子标本进行核酸检测和病毒分离;对分离到的病毒进行全基因组测序,运用EditSeq和MEGA5.05软件进行序列比对和进化分析。结果此次暴发疫情共报告流感样病例15例,罹患率为34.88%,核酸检
【机 构】
:
271000 泰安,泰山医学院;250014 济南,山东省疾病预防控制中心 山东大学预防医学研究院 山东省传染病重点实验室,272000 济宁市疾病预防控制中心,272000 济宁市疾病预防控制中心,
论文部分内容阅读
目的了解某禽类养殖场工人间的1起流感样病例暴发疫情的流行病学特点,确定疫情性质,分析流感病毒是否存在变异或基因重组,试阐述流感病毒来源。
方法采用个案调查等流行病学调查方法开展现场调查,采集所有流感样病例咽拭子标本进行核酸检测和病毒分离;对分离到的病毒进行全基因组测序,运用EditSeq和MEGA5.05软件进行序列比对和进化分析。
结果此次暴发疫情共报告流感样病例15例,罹患率为34.88%,核酸检测阳性率73.33%,分离到季节性A(H3N2)型流感病毒5株。进化分析显示分离到的H3N2流感病毒的8个基因片段均与2015—2016年流感疫苗株处于同一分支上,没有发生与禽或猪流感病毒的基因重组。5株流感病毒的血凝素(HA)有14个氨基酸位点发生了替换,其中8个位于抗原决定簇上;对神经氨酸酶基因和基质蛋白基因进行氨基酸推测分析显示,所有流感病毒均对神经氨酸酶抑制剂药物敏感,对M2离子通道抑制剂药物耐药。糖基化位点分析显示,NA新增两个糖基化位点NRT151-153、NAT245-247,其余基因未变。
结论此次暴发疫情为一起季节性A(H3N2)型流感病毒暴发,病毒发生了抗原漂移,未发现与禽流感、猪流感病毒基因重组的现象。
其他文献
目的研究乙型肝炎病毒X蛋白(HBx)与线粒体延长因子G1(EFG1)在酵母细胞及肝癌细胞内的相互作用。方法CytoTrap酵母双杂交法验证HBx蛋白与EFG1蛋白发生相互作用后,聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增EFG1基因,并克隆于真核表达载体pcDNA3.1/myc-His(-)A,确定测序正确并确认EFG1蛋白可在Huh7肝癌细胞表达后,将HBx
狂犬病疫苗自神经组织疫苗的诞生逐步发展到细胞疫苗,接种针次从起初实施的14~21针简化发展到如今临床普遍应用的4~5针。有4种免疫程序被世界卫生组织(World Health Organization, WHO)认可和推荐,分别是2种皮内多点注射法(intradermal injection, ID)和2种肌内注射法(intramuscular injection, IM)。最普遍应用的免疫程序是
丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)急性感染期一般是无症状的,大多数感染者不能清除该病毒容易发展成慢性感染,少部分感染者甚至发展为肝硬化、肝癌。传统的治疗方法是聚乙二醇干扰素联合利巴韦林方案,但抗病毒疗效不佳且不良反应较大,这可能与HCV能够通过多种机制逃避宿主的免疫反应有关。固有免疫应答是机体抵抗病原微生物的第一道防线,维甲酸诱导基因Ⅰ(Retinoic acid indu
目的探讨β1-肾上腺素能受体(β1-adrenoceptor, β1-AR)基因编码区1 165位单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)与肠道病毒A71(enterovirus A71, EV-A71)感染的关系。方法采用PCR体外扩增技术,通过对PCR产物进行Sanger测序,检测EV-A71手足口病(hand, foot and mouth d
目的了解江阴市2013—2015年常住人口中新发HIV-1感染者亚型分布及原发耐药基因变异情况。方法选取江阴市疾病预防控制中心2013—2015年确认和管理的111例常住人口新发HIV-1感染者为研究对象,收集其抗凝全血标本,提取DNA并扩增HIV病毒pol区部分基因,通过系统进化树判断患者亚型;根据WHO耐药突变位点列表及美国斯坦福大学HIV耐药数据库,确定耐药基因突变位点及耐药程度。结果111
目的了解2017年芜湖市诺如病毒疫情状况及其基因型别,为芜湖市诺如病毒流行防控提供分子流行病学基础资料。方法收集2017年芜湖市诺如病毒暴发疫情与聚集性病例标本,利用荧光定量PCR初步进行型别鉴定,应用RT-PCR和特异型引物对目的基因进行扩增,对诺如病毒序列进行比对和系统进化分析。结果芜湖市辖区17起诺如病毒疫情,共检测137份标本,实时荧光定量PCR结果显示77份诺如病毒核酸检测阳性,且全部为
目的了解咸阳市手足口病(hand,foot and mouth disease, HFMD)发病情况及主要流行特征,为制定预防措施提供依据。方法利用国家疾病信息管理系统收集咸阳市2013—2016年间HFMD病例个案;利用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测HFMD病例标本,应用统计软件SPSS19.0对资料进行分析。结果2013—2016年咸阳市HFM
人腺病毒(human adenoviruses, HAdVs)是一种无包膜的双链DNA病毒,可分为A~G共7组,80多种血清型或基因型,感染呼吸道的主要为HAdV-B,HAdV-C和HAdV-E组HAdVs,是呼吸道感染的重要病原之一。我国地域辽阔,不同地区流行的HAdVs优势基因型不同。本文对我国呼吸道感染HAdVs的基因型流行概况进行了综述,总结和分析了我国不同地区的HAdVs优势流行型别和新
目的明确沈阳地区柯萨奇病毒A组6型(coxackievirus A6, CV-A6)的流行特点和基因特征。方法收集2013—2017年沈阳地区手足口病非EV-A71非CV-A16肠道病毒阳性标本,应用荧光定量PCR方法进行CV-A6核酸的检测,对阳性标本进一步应用传统RT-PCR方法针对VP1全长基因进行扩增、序列测定和系统进化分析。结果沈阳地区2013—2017年间CV-A6占肠道病毒阳性标本的