植被覆盖度是反映生态环境质量的评价指标，掌握植被覆盖度的变化有助于实现生态文明建设与区域农牧业规划及生态环境保护。基于2001—2020年归一化植被指数（Normalization difference vegetation index，NDVI），以耕地、林地、草地植被类型为研究对象，采用混合像元二分模型计算植被覆盖度，应用空间稳定性分析、Sen+Mann-Kendall空间趋势分析、线性回归等方法，分析塔什库尔干塔吉克自治县植被覆盖度的时空特征。同时，结合气温、降水量数据，利用spearman相关分析、GIS空间分析等方法，分析气候因素对植被覆盖度的影响。结果表明：近20 a植被覆盖度以中植被覆盖区为主，植被覆盖度减小了4.79%；植被覆盖度的空间稳定性波动较小，以波动变化（37.3%）、中等波动变化（32.7%）为主；植被覆盖度呈显著减少和不显著减少的分别占总面积的3.8%、54.5%。耕地、林地、草地植被状况均呈现不同程度的轻微退化，在植被覆盖度上分别减少了4.57%、6.32%、4.24%，在空间稳定性上，不显著减少分别为51.28%、54.48%、52.29%。2001—2020年耕地比林地、草地空间稳定性和退化程度更为稳定和缓慢，林地退化比耕地、草地严重。研究区植被覆盖度变化较小，呈微弱下降趋势，人类活动是影响植被生长的主要因素。