中国大陆野猪SLA DRB基因exon2的序列变异分析

来源 :兽类学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：xielianqin

【摘要】

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本文基于135头野猪样本中检测到的15种SLA DRB基因exon2序列的遗传变异分析，探讨DRB基因在不同地理区域中自然选择的变化特征。研究发现DRB基因exon2抗原结合位点的非同义替换

【作者】

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丁栋沈菲菲张保卫李崇奇张晨岭周开亚常青

【机构】

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南京师范大学生命科学学院遗传资源研究所,安徽大学生命科学学院,海南医学院基础医学部

【出处】

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兽类学报

【发表日期】

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2008年2期

【关键词】

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野猪 DRB EXON 2 遗传变异平衡选择系统发生 Balancing selection DRB exon 2 Genetic variation

【基金项目】

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江苏省生物多样性与生物技术重点实验室基金资助项目

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本文基于135头野猪样本中检测到的15种SLA DRB基因exon2序列的遗传变异分析，探讨DRB基因在不同地理区域中自然选择的变化特征。研究发现DRB基因exon2抗原结合位点的非同义替换率为同义替换率的2．95倍，表明该位点受到平衡选择的强烈作用。在系统发生分析中，在基于核苷酸序列构建的NJ树中，野猪DRB位点的15种等位基因全部聚为一枝，没有发现跨种多态现象；而在基于氨基酸序列构建的系统发生树中，野猪SLA—DRB^＊ nnu6和人DRB基因exon2片段聚在一起，这种氨基酸残基的高度相似可能是由于

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