[目的]描述中国东部和中西部肿瘤登记地区恶性肿瘤发病率水平,比较分析东部与中西部发病率差异。[方法]利用2009年中国72个肿瘤登记处(东部44个,中西部28个)的恶性肿瘤发病及人口数据,按地区、性别和城乡分别计算发病率、标化发病率。运用负二项回归模型,以发病数为应变量,地区分类为自变量(中西部为参照),调整年龄、性别和城乡分类计算恶性肿瘤发病率比值及95%可信区间。[结果]2009年中国东部地区恶性肿瘤发病率、中标率与世标率分别为306.07/10万、149.22/10万和194.60/10万。中西部地区的恶性肿瘤发病率、中标率与世标率分别为231.53/10万、139.64/10万和182.27/10万。东部与中西部前6位主要恶性肿瘤相同,分别为肺癌、胃癌、结直肠癌、肝癌、乳腺癌和食管癌,但顺位略有不同。东部的结直肠癌和乳腺癌发病率和标化率均高于中西部地区,肺癌、胃癌、肝癌和食管癌的发病率高于中西部,标化率低于中西部地区。东部男性恶性肿瘤发病率是中西部的1.13倍,发病率差异最大的前3位恶性肿瘤依次为甲状腺癌、前列腺癌和肾癌,发病率比分别为1.89(95%CI:1.64~2.17)、1.66(95%CI:1.52~1.80)和1.42(95%CI:1.30~1.54)。东部女性恶性肿瘤发病率比为1.19(95%CI:1.08~1.31)。差异最大的前3位恶性肿瘤依次为甲状腺癌、肾癌和淋巴瘤,发病率比分别为1.98(95%CI:1.83~2.15)、1.48(95%CI:1.32~1.66)和1.47(95%CI:1.33~1.62)。[结论]中国东部与中西部地区恶性肿瘤发病率存在明显差异,科学评估恶性肿瘤发病率的地域差异可为肿瘤防治研究提供有价值的信息。