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在继承和集成相关研究的基础上,构建了医药制造业技术创新体系本地化的评价指标体系,应用主成分分析方法对2001~2012年中国各地区医药制造业技术创新体系本地化进行了实证分析。结果表明：中国各地区医药制造业技术创新体系本地化程度存在着较大的非收敛性且随着时间演进逐渐加剧,各地区医药制造业技术创新模式存在差异性,企业与大学在技术创新体系中的主导地位和企业创新竞争程度存在区域差异,其原因归结为创新资源分布、产业关联、校企合作和制度环境等因素。