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除二维凝胶电泳和质谱分析外,最近激光捕获显微切割技术电泳、靶蛋白芯片等新技术被应用于大肠癌蛋白质组的研究.继初期建立蛋白质组数据库后,大肠癌蛋白质组研究更加深入:在大肠粘膜恶性转化的分子机制研究中,发现在转化过程中和转化后有多种多肽或蛋白质的变化,不同的基因如p53基因和APC基因突变引起不同的细胞内变化;在放化疗机制方面的研究初步表明肿瘤化放疗后的改变涉及凋亡、信号传导等多种机制;在标志物的的研究方面发现了3个较特异的标志物--S100A8、S100A9、S100A11.