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针对序列拼接中的重复序列问题 ,提出了一种基于快速沃尔什变换的重复序列屏蔽方法 .根据快速沃尔什变换的特点 ,快速给出重复序列所在的可能位置信息 ,从而快速识别重复序列且加以屏蔽 .该方法不仅识别重复序列的错误率低而且大大降低了CPU运行时间 ,计算也简单易行 ,最后给出了模拟分析
DNA序列拼接中重复序列屏蔽的一种新方法
【摘 要】
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针对序列拼接中的重复序列问题 ,提出了一种基于快速沃尔什变换的重复序列屏蔽方法 .根据快速沃尔什变换的特点 ,快速给出重复序列所在的可能位置信息 ,从而快速识别重复序列
【机 构】
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华中科技大学数学系
【出 处】
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华中科技大学学报(自然科学版)
【发表日期】
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2004年08期
【基金项目】
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国防科技预研基金资助项目
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