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目的查明2005年7~8月发生在呼和浩特市一起儿童少年游泳后出现发热、咽痛、扁桃体红肿、眼结膜充血为特征的咽结膜热爆发的病原学病因和流行因素。方法制定病例临床诊断标准,采用统一的流行病学个案调查表对病例进行调查,描述流行特征;采用回顾队列调查的方法分析流行因素;对患者咽拭子、便标本进行聚合酶链反应(PCR)、对患者的血清进行抗体检测。结果2005年7~8月,呼和浩特市发生咽结膜热病例468例,疫情波及呼市四个市区,发病高峰为8月2日,病例主要为中小学生。病例的临床特征为发热伴咽痛、扁桃体炎、结膜炎。预后良好,无死亡病例。病例95.05%有游泳史。回顾队列调查显示发病危险因素与游泳馆游泳池水污染有关。PCR检测及血清学检测证实为腺病毒感染。对PCR阳性产物进行序列测定和分析,确定为腺病毒3型。结论发生在呼和浩特市咽结膜热爆发疫情的病原体为腺病毒,爆发主要是通过被污染游泳池水传播造成的。