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为了提高交通运输工程专业学位研究生的培养质量，构建解释结构模型，以解析影响专业学位研究生培养质量的指标因素，并获取各影响要素之间的递阶层次关系。在分析云南省社会经济发展需求的基础上，以昆明理工大学交通运输工程专业学位研究生培养模式为例，给出提升专业学位研究生培养质量的优化对策。结果表明：课程设计、跨学科教育、研究生培养质量评估体系与实践考核及激励制度，对专业学位研究生的培养质量具有重要影响，政府支持力度则是提升专业学位研究生培养质量的外部保障。