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以菜心为研究对象，初步建立起菜心的ISSR分子标记技术体系，包括DNA提取、退火温度、循环次数和引物筛选等。对退火温度进行优化，确定最佳退火温度为48℃，最优循环次数为45次。共筛选了49条引物，其中11条引物能扩增出多态性带，选择4个条带清晰的引物对6个品种进行扩增，共检测出32条带，其中多态性带为22务，多态性比例为68．80％，6个品种的遗传相似性系数为0．19～O．77。说明ISSR标记能够揭示材料间较高的遗传多样性，本试验为菜心的种子纯度鉴定和新品种选育提供理论依据。