流感、手足口病、SARS、禽流感等疾病都属于传染性疾病，由于具有流行性、传染性，祖国医学称之为瘟疫。人类与瘟疫的战争自古至今一直存在，而且异常惨烈。我国是一个瘟疫多发的国家，据史书记载从公元七世纪到二十世纪共发生过700多次规模较大的瘟疫流行，历史上对瘟疫的治疗不像现在能辨别是哪种病毒引起的，而且抗病毒药物也没有诞生，遇到瘟疫就是依靠中医中药。几千年来，中华民族繁衍生息，能与多种传染病抗争，可以说中医中药功不可没。
　　近年来，随着医学界的深入研究，中药的广谱抗病毒作用被一组组实验数据证实，得到了医学界的广泛认可。比如中药连花清瘟胶囊，该药汲取了祖国医学三个治疗传染性疾病的经典名方精华研制而成，它的广谱抗病毒作用已通过无数个实验结果得以证实。
　　
　　*抗呼吸道常见病毒
　　
　　中国中医科学院中药研究所对连花清瘟胶囊进行体外抗病毒实验表明，连花清瘟胶囊对甲型H3N2流感病毒、副流感病毒Ⅰ型（HVJ）、呼吸道合胞病毒（RSV）、腺病毒3型（ADV3）和7型（ADV7）、单纯疱疹病毒1和2型（HSV-1，HSV-2）均显示出一定的抑制作用，对甲型H3N2流感病毒、副流感病毒Ⅰ型（HVJ）、呼吸道合胞病毒抑制作用最强。在预防甲型H3N2流感病毒的研究中发现，连花清瘟胶囊效果优于抗病毒药利巴韦林。
　　
　　*抗甲型H1N1流感病毒
　　
　　广州医学院第一附属医院呼吸疾病国家重点实验室进行了连花清瘟胶囊防治甲型H1N1流感病毒FM1感染小鼠的实验研究（FM1是感染H1N1病毒后在人身上分离出来的，并可适用于感染动物的H1N1毒株），结果显示连花清瘟胶囊可平衡机体免疫状态以减轻FM1流感病毒引起的小鼠肺部炎性损伤，能显著改善流感病毒引起的小鼠肺炎症状及延长生命率，对甲1型流感病毒感染小鼠有死亡保护作用，对病毒性感冒显示了较好的疗效。
　　北京地坛医院选取66例甲型H1N1流感患者，分别使用连花清瘟胶囊与达菲随机临床试验，结果显示连花清瘟胶囊组病毒核酸阴转时间为3.32天，达菲组病毒核酸阴转时间为3.50天；平均住院时间连花清瘟胶囊组为4.35天，达菲组为4.60天；两组平均退热时间，连花清瘟胶囊为2.13天，达菲为2.80天，统计学差异显著。在改善咽痛、咳嗽、咳痰等症状方面连花清瘟组明显好于达菲组。
　　以首都医科大学附属佑安医院为组长单位，联合河南省传染病医院、湖南省疾控中心，沈阳市、成都市、济南市传染病医院等九家甲型流感收治医院，进行了连花清瘟与西药抗病毒药达菲对照治疗甲型H1N1流感循证医学研究。结果证实：连花清瘟病毒转阴率与达菲相当，退热时间优于达菲，缓解咳嗽、肌肉酸痛、乏力、头痛等症状均明显优于达菲，用药安全性高，而且价格低廉，仅为达菲的八分之一。
　　
　　*抗SARS病毒
　　
　　国家权威P3实验室在北京SARS流行期间从病人肺组织中分离出SARS病毒BJ01株和Vero-E6细胞研究体外抗病毒作用。结果表明，连花清瘟胶囊在Vero-E6细胞中对SARS病毒的抑制作用：抑制病毒的半数有效浓度（IC50）为0.09mg/ml，对SARS病毒的治疗指数为40.33；说明连花清瘟胶囊药物浓度大于0.09mg/ml，可明显抑制SARS病毒。
　　
　　*抗禽流感病毒
　　
　　中国农业科学院农业部动物流感重点开放实验室对连花清瘟胶囊进行了杀灭禽流感病毒实验，结果表明，每毫升含0.1g～0.25g生药的浓度范围内与禽流感病毒作用10分钟，对病毒的杀灭率可达99.99%，有显著的杀灭病毒作用；在0.5g～1g生药的浓度范围内与禽流感病毒作用10分钟，对病毒的杀灭率可达到100%，有完全杀灭病毒的作用。
　　
　　*抗手足口病病毒
　　
　　中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所科研人员，用连花清瘟颗粒药液进行杀灭肠道EV71病毒实验，结果证明连花清瘟颗粒在0.023～0.72mg/ml的浓度范围内，具有明显抗EV71病毒的作用，表明连花清瘟颗粒对手足口病的治疗作用。