面对困境，日本动漫业界从制作方式、作品内容、技术手段等多方面进行了积极的摸索与尝试。
　　“制作委员会”方式的广泛应用被认为是日本动漫业复兴的重要途径。之前的动画主要是由电视台委托给动画公司制作，但此种方式不仅成本高昂，而且风险巨大，为此负债累累甚至倒闭的动画公司不在少数。于是，资金不足的动画公司开始想方设法寻找赞助商，让他们投资制作动画，等动画播出后再与赞助商平分收益。此类由赞助商构成的“制作委员会”不仅限于动画，在电影、电视剧等行业也十分常见。
　　早在20世纪80年代，制作委员会已在《风之谷》《AKIRA》等动画电影中初露峥嵘。1992 年播出的《无责任舰长泰勒》被认为是第一部由制作委员会制作的电视动画。然而在公众的认知中，提到制作委员会，必然会联想到1995年横空出世的一部神作——《新世纪福音战士》。这部堪称平成动画里程碑的作品，以其庞大复杂的世界观、深奥晦涩的故事情节、意识流的叙事手法、细腻的心理描写、充满个性的人物塑造，一经播出就引发热议，成为日本历史上少有的能带来广泛社会影响的现象级作品。它被誉为“第三次动画革命”的代表作，对后来的动漫作品产生了深远影响。动画的风靡带动了相关音乐、游戏、手办、电影等的热卖，这种多元化的营销模式带来了巨大的商业利润。另外，对作品世界观、价值观的研究也经久不衰，从而使其成了“御宅族”文化的鼻祖。
　　这部至今仍为人津津乐道的作品，正是对制作委员会进行早期实验的产物，也正是它的成功使得制作委员会成为日本动画主流的制作方式。尽管如今制作委员会发生了许多变化，也有不少引人诟病之处，但在经济萧条的平成初期，这种方式无疑有力地解决了动画制作高投入、高风险的问题，为低迷的动画市场打了一剂强心针。
　　除了制作委员会之外，以光碟形式发售的原创视频动画（OVA）也是平成初期动漫的特色之一。OVA常用于制作一些篇幅较短的作品，或是正式制作电视动画之前的试验，或是电视动画的番外篇或续集。它面向的是某个特定作品的爱好者，有精準的目标人群定位。因为篇幅短小，它比长篇电视动画更加灵活，题材也更加广泛。几乎所有大受好评的电视动画，如《哆啦A梦》《樱桃小丸子》《七龙珠》等均推出过OVA版。
　　从20世纪90年代初期到中期，日本动漫业通过不断的摸索和创新，渐渐走出低迷，开创出一条适合国情的发展道路。

“动漫外交”

　　平成年间，日本政府在文化方面最广为人知的举措便是提出了“文化立国”的口号，并积极付诸实施。1990年代中期到2000年代中期，日本动漫业正是乘此东风扶摇直上，在政府的扶持下冲出国门，走向世界。
　　平成元年（1989年）7月，日本成立了文化政策推进会。1996年，该推进会提出了“新文化立国的目标”，次年又提出了《新文化立国目标的具体施政方案》，标志着“文化立国”战略的正式确立。动漫产业作为重点文化产业，被提到了国家战略的高度，加快了国际化的步伐。

　　虽然从1960年代开始，日本动画已输出到海外，广受好评，但整个海外市场并不算繁荣，因销售价格低，缺乏周边产品，没有为日本带来太大的经济利润。进入平成年间，《七龙珠》《美少女战士》等热门电视动画相继登陆美国，其精良的制作、可爱的人物、激烈的战斗场面深深吸引了当地观众，相关周边产品和游戏的售卖也带动了整个海外市场的发展。

　　进入21世纪后，日本政府进一步认识到了动漫的重要性，开始着力打造世界首屈一指的动漫王国。2004年，日本政府提出了“酷日本”的口号，动漫成为其中重要的组成部分；2005年，时任首相小泉纯一郎提出了文化外交的三个理念，其中包括在世界上积极培养具有国际视野、“爱好日本动漫的世代”。2006年4月，时任日本外相麻生太郎发表了题为“文化外交的新构想”的演讲，要求大力开展“动漫外交”。2008年，日本政府任命“哆啦A梦”为首任“动漫文化大使”。这一系列的政策和举措都表现出了日本政府发展动漫产业的野心和决心。在政府的大力支持下，日本动漫的数量和质量都有了飞跃。
　　相比充满娱乐精神和个人英雄主义的美国动画，日本动画更富有批判精神和人文情怀，这一点在以宫崎骏作品为代表的动画电影中体现得淋漓尽致。比如囊括柏林电影节金熊奖、奥斯卡金像奖最佳动画长片等多项大奖的《千与千寻》，就通过描绘一个少女成长的童话故事，深刻地揭示了人性的贪婪、懦弱、自私，批判了唯利是图的资本主义社会，谴责了人类对自然环境的破坏，表达了对人类生存环境和未来命运的忧思。作为日本动画电影领军者的吉卜力工作室自成立以来便佳作不断，进入平成年代后更是屡获世界级动画大奖，如曾获动画安妮奖的《幽灵公主》《虞美人盛开的山坡》、获威尼斯电影节金狮奖提名的《悬崖上的金鱼姬》、获奥斯卡金像奖最佳动画长片提名的《哈尔的移动城堡》《起风了》《辉夜姬物语》等。此类富有内涵的佳作不断问世，提升了日本动漫在世界范围内的知名度。

　　此时的日本动漫业界已探索出一条成熟的产业链模式：首先通过漫画连载的方式打响知名度，契合市场需求。接着制作电视动画，获得成功后马上推出相关游戏和周边产品。通过这条“漫画——动画——游戏——衍生品”的产业链，漫画家、出版社、动画公司、电视台、版权代理商、衍生品生产商和经销商等就可以通过打造多元化的动漫IP实现盈利，从而促进动漫市场的良性循环。
　　平成年代中期动漫业进入了高度繁荣时期，互联网的兴起更有助于最新的日本动画作品和动漫资讯第一时间传播到海外，加速了动漫业的兴盛。

跨媒体动漫IP

　　从2000年代后期开始，日本社会和世界形势的变化使得動漫业又呈现出新的发展态势。首先，受少子化的影响，面向儿童的动画数量锐减，这使得深夜动画异军突起，占据动画总数的半壁江山，作品的内容类型变得越加宽泛。其次，随着互联网和智能手机的普及，在线观看动画的网站和APP不断增加，在打击盗版、拓宽发行渠道的同时，也进一步提高了粉丝的参与度。此外，多元化动漫IP 的模式更加成熟，并逐渐演变为涵盖更多领域的“跨媒体”超级IP。
　　2006年放映的《凉宫春日的忧郁》便是一部带有新时代特征的“现象级”动漫作品。它改编自同名轻小说系列，描写了自称对普通人类没兴趣，喜欢与外星人、未来人、超能力者打交道的主人公凉宫春日的不可思议的校园生活。这部略显无厘头的作品是动画业与轻小说业进行商业合作的新尝试，且迎合了当时日本年轻人厌倦无趣、追求新奇的心态，因而风靡一时。
　　网络的发达更为作品的火爆推波助澜，片尾曲《ハレ晴れユカイ》在世界范围内引发的舞蹈狂潮，至今仍让不少动漫迷记忆犹新。由于片尾曲动画中的舞蹈动作简单易学且节奏感十足，引来粉丝们竞相模仿。最初只是动漫爱好者在漫展或学校联欢会上表演，后来随着视频被传到社交网站，越来越多的人抱着凑热闹的心态加入到模仿“凉宫舞”的队伍中来，这种热潮很快席卷全世界。一时间，社交网站上充斥着各国青少年身穿cosplay服装，扭动腰肢尽情热舞的视频。这种网络世界与现实世界的互动，粉丝们跨域国籍、地域的集体狂欢，是前所未有的。

　　互联网改变了人们的生活，也让动漫业发生了翻天覆地的变化。观众不再是被动地观赏作品，而是可以通过网络随时对动漫作品进行评论、交流，或者用图片、视频、文章、cosplay等方式进行二次创作。注重与观众的互动，提高粉丝的参与感，是平成后期动漫的一大特色。比如2017年大热的动画《兽娘动物园》就是一个典型的例子。故事以虚构动物园Japari Park为舞台，讲述受砂之星影响变为Friends的拟人化野生动物们的故事，是一个涵盖动画、游戏、漫画的跨媒体作品。2015年首先推出的手机游戏没有激起太大波澜，但两年后推出的动画却出人意料地大受关注，以黑马之姿席卷了各大排行榜。究其原因，以“推特”为代表的社交网站（社交软件）功不可没。动画展现的是游戏之后的世界，所以游戏中许多未解之谜可以在动画中揭开。动画中有许多隐藏信息，比如一闪而过的画面中藏着关键性线索。细心的网友发现后，便把截图发到推特上，并为之附上“兽娘动物园考察班”的标签。久而久之，这样的“考察”引起了广大网友的兴趣，大家竞相加入“考察班”，投身于寻找和讨论线索的游戏中。反复播放视频的行为让这部冷门动画意外走红。