目的：研究肛肠疾病患者手术切口出现感染的病原菌特点。方法：我院选择2013年5月～2015年5月间诊治的574例实施肛肠疾病手术的患者，对其手术切口感染（SSI）的危险因素进行分析。结果：通过对所选的574例患者进行分析，其中118例出现手术切口感染，感染率达到20.6%，其中76例为痔疮感染，占20.4%；24例为肛瘘，占20.7%；18例为肛裂，占20.9%。118例患者共分离出76株病原菌，阳性率为64.4%；其中81.5%为革兰阴性菌，13.2%为革兰阳性菌，5.3%为真菌；革兰阳性菌主要见于大肠埃希菌、克雷伯菌属、变形菌属及肠杆菌属；革兰阴性菌主要见于表皮葡萄球菌和肠球菌属。通过研究发现，对感染产生影响的因素主要是年龄超过40岁，手术时间超过100min，BMI不低于25。结论：肛肠疾病患者术后出现手术切口感染主要的病原菌为革兰阴性菌，导致感染的主要因素包括患者的年龄、手术时间以及 BMI，通过对其进行积极有效的预防能够很好的降低肛肠疾病患者术后手术切口出现感染的几率。