2010-2012年青岛地区手足口病病原谱及柯萨奇 A10型的分子流行病学研究

来源 :中华微生物学和免疫学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:thskaoyan
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读

目的 阐明2010-2012年青岛地区手足口病( HFMD)病原谱及相关柯萨奇病毒A10( CVA10)型基因特征。方法用荧光RT-PCR法对HFMD患者咽拭子标本进行总肠道病毒( EV)、柯萨奇病毒A16(CVA16)型和肠道病毒71(EV71)型检测,然后用半巢式反转录PCR进行肠道病毒VP1基因部分序列扩增,再结合序列分析鉴定血清型;对CVA10阳性分离株进行VP1基因全长序列扩增及基因序列测定,用MEGA5.0软件进行系统发育分析及分子特征分析。结果2010-2012年间,共检测1919个手足口病门诊轻症病例和1336个住院重症病例;门诊轻症病例中,2010年和2012年以CVA16为主,各占轻症病例总阳性数的53%和73%,而2011年以EV71为主,占轻症病例总阳性数的78%;住院重症病例中,EV71为2010年和2011年主要病原,各占重症病例总阳性数的70%和86%;其他型别(非CVA16、非EV71)肠道病毒在2012年住院重症病例中成为主要病原,占重症病例总阳性数的44%;2010-2012年分别检出其他型别肠道病毒19株、16株和22株,其中CVA10检出率最高;23株CVA10的VP1全长基因序列进化分析表明这23株CVA10病毒全部属于C基因型,它们VP1基因氨基酸序列同源性为97.3%~100.0%,与其他地区同期参考株相比无显著差异。结论2010-2012年间,CVA16和EV71是引起青岛地区手足口病流行的主要病原,同时伴有多种其他型别肠道病毒流行,其中C基因型CVA10分离率较高,它们相互间同源性较高,与其他地区同期参考株相似。

其他文献
大肠癌是最常见的恶性肿瘤之一,随着我国经济发展以及人群膳食结构、生活方式的转变,其发病率逐年升高。长期以来,大肠癌的早期诊断基本靠传统的肠镜检查,对被检查者有一定的诊疗风险和痛苦,不易于推广。研究发现,哺乳动物肠道中有多达1000余种、1014个以上的细菌与之共存。肠道菌群的生态状况、其代谢产物及产生的抗原可通过与机体代谢和免疫的相互作用对宿主产生巨大的影响,与肠癌的发生密切相关[1]。了解大肠癌
碳青霉烯类抗生素是20世纪70年代后期在沙纳霉素基础上研发出来的一类抗菌谱最广,抗菌活性最强的非典型β-内酰胺类抗生素[1-2],对质粒介导的超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)、染色体及质粒介导的头孢菌素酶(AmpC酶)均具有高度稳定性,已经成为治疗严重细菌感染最主要的抗菌药物之一。碳青霉烯类抗生素通过抑制胞壁黏肽合成酶,即青霉素结合蛋白(PBPs),从而阻碍细胞壁黏肽合成,使细菌胞壁缺损,菌体膨胀
目的 建立一种高通量人类免疫缺陷病毒表型耐药性检测方法。方法通过酶切连接方式失活荧光素酶基因,用LacZ基因替代原有的蛋白酶和逆转录酶基因。通过PCR方法从含耐药基因的pSG3△env质粒中扩增pol基因,用infusion定向克隆技术连接入酶切后的pNL4-3.Lac,对该表型耐药性检测方法的主要影响因素进行优化。结果构建了用于高通量耐药性检测的pNL4-3.Lac,确定了检测方法中细胞加入量为
不良妊娠结局包括自然流产、死胎、早产、胎儿宫内发育迟缓、畸形等。病原微生物感染是导致不良妊娠的重要原因,其中病毒感染不可小视。研究发现,在自然流产的胚胎或死胎组织中,人巨细胞病毒、单纯疱疹病毒、EB病毒等病毒核酸检出率高达34%[1-2]。妊娠早期,病原体引起子宫内膜、胎盘炎症可导致胎儿染色体异常;胎儿发育过程中,病原体还可通过活化母体巨噬细胞和 T 淋巴细胞,释放TNF-α、IL-1、IL-6等
目的 利用西安市传染病报告系统数据、疫苗接种情况和健康人群病原监测结果,综合分析控制流行性脑脊髓膜炎(流脑)因素。方法用描述流行病学方法分析流脑的历年流行情况、病原携带率和发病控制效果。结果西安市流脑1951-1984年期间发病率为22.51/10万,1984年计划免疫实施后发病率开始呈大幅度下降趋势,20世纪80年代发病率平均为4.87/10万,90年代平均为0.59/10万,2001-2011
目的 探讨舟山海岛地区严重发热伴血小板减少综合征( severe fever with thrombocy-topenia syndrome,SFTS)患者淋巴细胞亚群及白细胞介素-2受体(CD25)表达的特征。方法采用血细胞分析仪、全自动生化仪及流式细胞仪分别检测SFTS患者治疗前及治疗10 d后外周血血常规、血生化、淋巴细胞亚群,统计学分析其动态变化及相关关系。结果 SFTS患者治疗前白细胞、
数字对象惟一标识符(digital object identifier,DOI)是对包括互联网信息在内的数字信息进行标识的一种工具。在传统的出版物中,书刊、磁带、光盘都有国际标准编号(ISBN、ISSN、ISCN)及其条形码,作为出版物的惟一标识。这些标识使出版物得到有效的管理,便于读者查找和利用。而网上的文档一旦变更了网址便无从追索。数字信息标注 DOI 如同出版物的条形码,是一个永久和惟一的标
目的 探讨CD4+CD25+/highCD127low/-和CD14+HLA-DRlow/-预测急性胰腺炎严重程度的作用。方法流式细胞仪检测AP患者( acute pancreatitis , AP)外周血CD4+CD25+/high CD127 low/-、CD14+HLA-DRlow/-、CD64指数的水平,并与C-反应蛋白(CRP)、急性生理学与慢性健康状况评分系统Ⅱ( APACHEⅡ)评分
目的 了解浙江西天目山家畜和啮齿动物中流行的立克次体无形体属种型,分析其16S rRNA基因变异。方法从动物肝脾和血液中提取DNA,PCR扩增无形体属16S rRNA片段;测序,采用MEGA5.0软件进行序列比对和系统发生分析。结果129只动物中,1只牛、8只羊、8只啮齿动物检出无形体属16S rRNA 片段,序列比对和系统发生分析表明,检出的无形体属16S rRNA包括嗜吞噬细胞无形体、边缘无形
目的:对来自北京儿童医院的两份人冠状病毒NL63(human coronavirus NL63, HCoV-NL63)阳性样本进行病毒全基因组序列测定和分析。方法以荷兰株(NL63_Amsterdam 1)为参考株,设计18对包含重叠区域的、覆盖全长基因组的引物,采用病毒RNA提取、RT-PCR分段克隆测序的方法获得NL63国内株全长基因组序列;通过与其他毒株的比对分析,构建其系统发生树。结果NL