牛樟EST-SSR标记的开发及遗传多态性分析

来源 :热带作物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lv_dan1102
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本研究通过测序牛樟叶片cDNA获得17 046条Uni-EST,从中检测出1 316个SSR位点,平均每25.7 kb EST含1个SSR位点。功能注释发现1242条SSR-EST中有690条可被划分为3大功能类、18个功能亚类。牛樟EST-SSR二核苷酸重复类型出现频率最高,三核苷酸次之。184类重复基序中AG/CT出现频率最高(32.4%),其次为AAG/CTT(9.3%)。从1 242条SSR-EST设计SSR引物537对,随机选取150对检测牛樟的多态性及在香樟、大叶樟和沉水樟中的可转移性。结果表
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