【摘 要】
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喀西茄(Solanum aculeatissimum)具有药用价值和园林观赏价值,目前国内外对喀西茄香味表达的相关研究以及开发利用较少,主要集中在其药用价值和栽培技术。本研究以云南省昆明市野生种喀西茄果实为试材,研究喀西茄不同生长发育阶段香味表达的差异性,以表型差异明显的两个不同成熟阶段喀西茄果实“绿熟期”和“黄熟期”为材料,探究影响果实香味合成的关键基因。基于高通量测序技术平台Illumina进
【机 构】
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西南林业大学园林园艺学院云南省面向南亚东南亚经济林全产业链联合研发中心云南省高效经济林培育示范型国际科技合作基地
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喀西茄(Solanum aculeatissimum)具有药用价值和园林观赏价值,目前国内外对喀西茄香味表达的相关研究以及开发利用较少,主要集中在其药用价值和栽培技术。本研究以云南省昆明市野生种喀西茄果实为试材,研究喀西茄不同生长发育阶段香味表达的差异性,以表型差异明显的两个不同成熟阶段喀西茄果实“绿熟期”和“黄熟期”为材料,探究影响果实香味合成的关键基因。基于高通量测序技术平台Illumina进行转录组测序,结果共获得54 337条单基因簇(unigene)。将获得的unigenes与非冗余蛋白数据库、基因本体数据库、东京基因与基因组数据库等数据库进行比对,结果显示:分别有28 610、22 805、3 599条unigenes成功获得注释。“绿熟期”与“黄熟期”对比有514个上调DEGs和1 151个下调DEGs。GO富集分析发现,DEGs主要富集在细胞、细胞组分等生物过程。利用实时荧光定量PCR对DEGs进行表达模式验证,发现其与RNA-Seq测序结果一致,证实了测序结果的准确性。研究结果丰富了喀西茄的转录组序列资源,初步获得调控果实香味的候选因子,为进一步开展基因功能提供了理论支持。
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