【摘 要】
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运用生物信息学方法从miRBase数据库中搜索动物物种miR-31基因家族成员的成熟序列,分析其分子进化特征并预测作用靶基因.结果表明,在49个动物物种中获得63条miR-31基因同源序
【机 构】
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盐城师范学院生命科学与技术学院,扬州大学动物科学与技术学院
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运用生物信息学方法从miRBase数据库中搜索动物物种miR-31基因家族成员的成熟序列,分析其分子进化特征并预测作用靶基因.结果表明,在49个动物物种中获得63条miR-31基因同源序列;miR-31家族成员大部分位于基因间隔区,少数位于内含子区;miR-31不仅存在于常染色体上,而且部分位于性染色体上.miR-31成熟序列长度在21 ～24 nt之间,序列同源性较高,部分位点在进化过程中发生了碱基突变和缺失.系统进化树显示,miR-31家族成员可分为2个分支.预测到哺乳动物miR-31拥有20个共同候选靶基因,与细胞生长发育、新陈代谢、信号转导、跨膜运输以及转录调控等过程密切相关.研究结果为深入理解miR-31基因家族的生物学功能奠定基础,也为后续研究提供理论依据.
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