【摘 要】
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目的 对猪源副流感病毒5型(parainfluenza virus 5,PIV5) SH毒株进行全基因组测序及分析.方法 根据GenBank中登录的猪源PIV5基因组序列设计10对引物,采用RT-PCR法对各片段进行扩增、测序,并对获得的PIV5-SH株全基因组序列进行遗传进化性分析.结果 PIV5-SH毒株基因组长15246 nt,与传统毒株PIV5-W3A核苷酸序列同源性为98.7％.基于全基因组构建的遗传进化树显示,PIV5-SH毒株与韩国犬源PIV5(1168-1)、中国孟加拉虎源PIV5 (PI
【机 构】
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黑龙江八一农垦大学动物科技学院,黑龙江大庆163319
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目的 对猪源副流感病毒5型(parainfluenza virus 5,PIV5) SH毒株进行全基因组测序及分析.方法 根据GenBank中登录的猪源PIV5基因组序列设计10对引物,采用RT-PCR法对各片段进行扩增、测序,并对获得的PIV5-SH株全基因组序列进行遗传进化性分析.结果 PIV5-SH毒株基因组长15246 nt,与传统毒株PIV5-W3A核苷酸序列同源性为98.7％.基于全基因组构建的遗传进化树显示,PIV5-SH毒株与韩国犬源PIV5(1168-1)、中国孟加拉虎源PIV5 (PIV5-HMZ)、中国东北虎源PIV5(PIV5-SR)及中国小熊猫源PIV5(ZJQ-221)具有较近的亲缘关系,与传统毒株W3A亲缘关系较远.进一步以PIV5 NP、F及HN基因构建遗传进化树显示,PIV5-SH毒株与PIV51168-1、PIV5-HMZ、PIV5-SR、PIV5 ZIQ-221和PIV5-CAN毒株亲缘关系近.结论 PIV5不同分离株基因差异较小,表现出一定的遗传稳定性.
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